More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6306 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 595 aa  1218    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  46.23 
 
 		 1656 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  45.18 
 
 		 2762 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  44.01 
 
 		 725 aa  489  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  44.01 
 
 		 725 aa  488  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  45.2 
 
 		 1067 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 		 611 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  42.65 
 
 		 2997 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  41.97 
 
 		 596 aa  474  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  40.33 
 
 		 614 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  44.58 
 
 		 2791 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  43.81 
 
 		 592 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  42.9 
 
 		 617 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  42.9 
 
 		 617 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  42.51 
 
 		 586 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  42.57 
 
 		 617 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  40.96 
 
 		 588 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  43.28 
 
 		 2103 aa  434  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  43.55 
 
 		 6403 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  42.33 
 
 		 2820 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  41.72 
 
 		 620 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  41.24 
 
 		 579 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  40.35 
 
 		 991 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  42.35 
 
 		 4332 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  43.49 
 
 		 2250 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  41.34 
 
 		 4336 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  44.66 
 
 		 4318 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  43.55 
 
 		 4342 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  41.83 
 
 		 4336 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  41.38 
 
 		 4317 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 		 597 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  41.62 
 
 		 4317 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  40.9 
 
 		 1474 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  41.62 
 
 		 4317 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  39.17 
 
 		 581 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  39.21 
 
 		 597 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  39.59 
 
 		 581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 		 602 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  41.27 
 
 		 4317 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  40.94 
 
 		 1801 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  42.91 
 
 		 4342 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  40.66 
 
 		 578 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.85 
 
 		 6889 aa  392  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  39.4 
 
 		 2721 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  41.65 
 
 		 1291 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  41.65 
 
 		 1283 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  40.23 
 
 		 1776 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  42.65 
 
 		 1276 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  40.11 
 
 		 1789 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 		 1272 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  40.27 
 
 		 1323 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  37.84 
 
 		 1753 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  40.51 
 
 		 3231 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  42.55 
 
 		 3208 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  40.26 
 
 		 755 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  37.67 
 
 		 608 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  39.57 
 
 		 1779 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  39.02 
 
 		 574 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  43.36 
 
 		 610 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  43.36 
 
 		 599 aa  364  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  43.17 
 
 		 610 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  43.17 
 
 		 599 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  43.17 
 
 		 610 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  43.17 
 
 		 599 aa  361  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  37.12 
 
 		 564 aa  358  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  37.12 
 
 		 559 aa  358  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  39.1 
 
 		 3235 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  41.62 
 
 		 1981 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  37.81 
 
 		 559 aa  357  5e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 622 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  39.19 
 
 		 706 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  39.21 
 
 		 1292 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 684 aa  351  2e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.839841  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 599 aa  348  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 609 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1459  AMP-binding domain-containing protein  39.56 
 
 		 621 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0838  AMP-binding domain-containing protein  39.56 
 
 		 621 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2154  AMP-binding domain-containing protein  39.56 
 
 		 621 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  40.27 
 
 		 6274 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  40.27 
 
 		 6272 aa  337  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  40.27 
 
 		 6271 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0523  AMP-binding enzyme  39.56 
 
 		 621 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.746199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1849  AMP-binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 621 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0427  AMP-binding enzyme  39.39 
 
 		 621 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  35.82 
 
 		 593 aa  334  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 		 701 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 636 aa  332  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 593 aa  331  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 640 aa  330  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  38.78 
 
 		 606 aa  324  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  38.29 
 
 		 1699 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 		 597 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.17 
 
 		 629 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.88 
 
 		 637 aa  320  5e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34 
 
 		 629 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34 
 
 		 629 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.27 
 
 		 629 aa  319  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 		 555 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 		 601 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>