More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1714 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  99.67 
 
 
599 aa  1181    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  99.67 
 
 
599 aa  1181    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  99.84 
 
 
610 aa  1203    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  99.34 
 
 
610 aa  1196    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  99.67 
 
 
599 aa  1181    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
610 aa  1207    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  50.09 
 
 
609 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  47.24 
 
 
2791 aa  486  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  43.08 
 
 
2762 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  42.56 
 
 
2997 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  44.69 
 
 
1656 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  44.21 
 
 
1067 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  40.54 
 
 
725 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  40.54 
 
 
725 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 
614 aa  436  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  41.92 
 
 
596 aa  438  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  42.73 
 
 
602 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  39.73 
 
 
611 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  46.91 
 
 
1474 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  43.76 
 
 
579 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  42.1 
 
 
586 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  40.14 
 
 
597 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  39.8 
 
 
597 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  45.17 
 
 
6403 aa  415  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  43.59 
 
 
578 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  43.82 
 
 
2103 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  39.69 
 
 
588 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  44.54 
 
 
2250 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  42.28 
 
 
592 aa  399  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.71 
 
 
6889 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  39.1 
 
 
581 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  42 
 
 
2820 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  38.46 
 
 
581 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  44.54 
 
 
599 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
991 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  42.81 
 
 
4342 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  41.33 
 
 
4317 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  42.63 
 
 
4342 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  40.81 
 
 
4317 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  41.89 
 
 
4318 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  41.26 
 
 
4317 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  43.93 
 
 
701 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  40.85 
 
 
1272 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  41.99 
 
 
755 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  41.65 
 
 
2721 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  43.02 
 
 
4336 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  41.59 
 
 
608 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  39.26 
 
 
593 aa  372  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  43.17 
 
 
595 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  43.43 
 
 
606 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  41.95 
 
 
706 aa  365  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  41.03 
 
 
4317 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  41.49 
 
 
4332 aa  364  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  40.32 
 
 
1753 aa  363  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  40.7 
 
 
4336 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  41.43 
 
 
1291 aa  360  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  41.43 
 
 
1283 aa  359  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  42.23 
 
 
1276 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  41.08 
 
 
1323 aa  355  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 
1292 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  44.47 
 
 
3208 aa  353  4e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  38.09 
 
 
1801 aa  353  5e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  41.78 
 
 
4268 aa  351  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1588  AMP-binding domain-containing protein  43.99 
 
 
605 aa  350  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  43.99 
 
 
605 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0181  peptide synthetase NRPS5-4-3  44.16 
 
 
1005 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  40 
 
 
3235 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  41.1 
 
 
622 aa  342  9e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18360  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.59 
 
 
577 aa  342  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  39.51 
 
 
617 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  40 
 
 
3231 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1459  AMP-binding domain-containing protein  41.98 
 
 
621 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0838  AMP-binding domain-containing protein  41.98 
 
 
621 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2154  AMP-binding domain-containing protein  41.98 
 
 
621 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  36.68 
 
 
564 aa  337  5e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  40.66 
 
 
617 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0523  AMP-binding enzyme  41.98 
 
 
621 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.746199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  39.69 
 
 
1981 aa  336  7e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  40.66 
 
 
617 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0427  AMP-binding enzyme  41.79 
 
 
621 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1849  AMP-binding domain-containing protein  41.79 
 
 
621 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  36.68 
 
 
559 aa  335  1e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  40.53 
 
 
1789 aa  335  1e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  41.96 
 
 
555 aa  335  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  34.54 
 
 
619 aa  333  4e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 
684 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.839841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  40.27 
 
 
6271 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  39.47 
 
 
1776 aa  330  6e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  40.69 
 
 
1699 aa  329  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  40.08 
 
 
6272 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 
551 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  40.08 
 
 
6274 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  37.9 
 
 
620 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  38.5 
 
 
559 aa  323  5e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  40.14 
 
 
4165 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  36.76 
 
 
601 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  36.76 
 
 
601 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  36.76 
 
 
601 aa  317  6e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  35.68 
 
 
738 aa  316  8e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  36.25 
 
 
580 aa  314  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>