More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0174 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.24 
 
 		 637 aa  719    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.68 
 
 		 629 aa  739    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  54.96 
 
 		 593 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.81 
 
 		 629 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  69.73 
 
 		 640 aa  913    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.49 
 
 		 629 aa  745    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.65 
 
 		 629 aa  748    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 636 aa  1310    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  54.96 
 
 		 593 aa  648    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.65 
 
 		 629 aa  748    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3855  putative fatty-acid--CoA ligase  50.41 
 
 		 605 aa  592  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724696  hitchhiker  0.00746256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  48.95 
 
 		 620 aa  589  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3869  putative fatty-acid--CoA ligase  50.41 
 
 		 605 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3943  putative fatty-acid--CoA ligase  50.41 
 
 		 605 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.082676  normal  0.0172927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2966  putative fatty-acid--CoA ligase  47.65 
 
 		 607 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.453521  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  43.57 
 
 		 574 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 		 597 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  38.38 
 
 		 626 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  37.1 
 
 		 619 aa  372  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  38.17 
 
 		 592 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  38.21 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  38.01 
 
 		 592 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  38.64 
 
 		 576 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  36.89 
 
 		 590 aa  364  3e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  39.03 
 
 		 580 aa  362  8e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  36.73 
 
 		 590 aa  362  9e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  36.73 
 
 		 590 aa  362  9e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  38.86 
 
 		 631 aa  360  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  38.86 
 
 		 580 aa  359  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  38.8 
 
 		 584 aa  357  5e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  38.23 
 
 		 577 aa  357  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  38.86 
 
 		 583 aa  353  8e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  37.9 
 
 		 580 aa  352  2e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 		 592 aa  350  3e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 596 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  35.28 
 
 		 573 aa  348  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 611 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  34.65 
 
 		 2997 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.21 
 
 		 2762 aa  343  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  36.94 
 
 		 573 aa  342  2e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  36.02 
 
 		 601 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  36.02 
 
 		 601 aa  340  4e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  36.02 
 
 		 601 aa  340  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  37.71 
 
 		 584 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 614 aa  338  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 579 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 595 aa  332  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 725 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  36.95 
 
 		 2103 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  34.83 
 
 		 1067 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 725 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 991 aa  330  7e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  34.88 
 
 		 1656 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 597 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 578 aa  323  5e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 		 582 aa  322  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  33.5 
 
 		 588 aa  320  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10409  acyl-CoA synthetase  36.21 
 
 		 585 aa  321  3e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 602 aa  320  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.24 
 
 		 4342 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  35.25 
 
 		 3231 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  35.55 
 
 		 3235 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  34.67 
 
 		 2791 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  35.69 
 
 		 4332 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  36.49 
 
 		 1474 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  34.16 
 
 		 2820 aa  313  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  35.91 
 
 		 2250 aa  313  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  35.71 
 
 		 2721 aa  313  6.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 599 aa  312  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.12 
 
 		 4342 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 586 aa  310  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  35.93 
 
 		 6889 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.65 
 
 		 1801 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 593 aa  305  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  32.08 
 
 		 581 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  34.99 
 
 		 4336 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  34.81 
 
 		 4317 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  31.64 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 		 608 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  33.77 
 
 		 4317 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  33.06 
 
 		 755 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.16 
 
 		 4336 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  32.69 
 
 		 1323 aa  296  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  34.15 
 
 		 4317 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33.88 
 
 		 4317 aa  293  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.03 
 
 		 6403 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  35.1 
 
 		 609 aa  290  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  34.59 
 
 		 4318 aa  286  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  32.51 
 
 		 1283 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 1272 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  32.51 
 
 		 1291 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  32.78 
 
 		 1276 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  35.48 
 
 		 3208 aa  281  3e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  33.8 
 
 		 1776 aa  280  7e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  32.81 
 
 		 617 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  32.81 
 
 		 617 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  35.05 
 
 		 1699 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  34.05 
 
 		 4165 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  32.19 
 
 		 617 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>