More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3181 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  57.26 
 
 
1656 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
596 aa  1236    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  51.52 
 
 
2762 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  52.88 
 
 
725 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  53.05 
 
 
725 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  52.45 
 
 
2791 aa  615  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  49.18 
 
 
611 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  49.43 
 
 
614 aa  608  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  50.26 
 
 
2997 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  50.96 
 
 
991 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  51.3 
 
 
586 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  48.61 
 
 
2103 aa  543  1e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  44.82 
 
 
1067 aa  513  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  42.59 
 
 
602 aa  495  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  43.67 
 
 
597 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  43.67 
 
 
597 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  44.39 
 
 
592 aa  488  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  44.27 
 
 
1474 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  42.71 
 
 
588 aa  480  1e-134  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  44.65 
 
 
2250 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  43.77 
 
 
6403 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  41.97 
 
 
595 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  42.68 
 
 
579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  43.61 
 
 
2820 aa  469  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  38.96 
 
 
617 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 
578 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  41.11 
 
 
581 aa  440  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  38.96 
 
 
617 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  41.21 
 
 
608 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  38.96 
 
 
617 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  41.78 
 
 
4342 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  41.35 
 
 
581 aa  437  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  41.29 
 
 
4332 aa  438  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  38.29 
 
 
620 aa  438  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  39.26 
 
 
4317 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  41.15 
 
 
4342 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  40.35 
 
 
4336 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  40.07 
 
 
4336 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  41.13 
 
 
599 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  38.77 
 
 
4317 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  41.16 
 
 
4318 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  38.73 
 
 
4317 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  41.92 
 
 
599 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  41.92 
 
 
599 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  41.92 
 
 
610 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  38.38 
 
 
4317 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  41.92 
 
 
610 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  41.92 
 
 
599 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  41.92 
 
 
610 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  38.57 
 
 
1753 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.1 
 
 
6889 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  40.15 
 
 
1801 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  36.72 
 
 
755 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  38.77 
 
 
2721 aa  404  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  38.63 
 
 
1291 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  38.63 
 
 
1283 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  38.29 
 
 
1323 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  38.76 
 
 
3235 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  38.65 
 
 
1276 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  39.02 
 
 
609 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  38.3 
 
 
593 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  38.25 
 
 
1789 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  37.88 
 
 
559 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 
1272 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  37.99 
 
 
559 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  37.99 
 
 
564 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  39.05 
 
 
1776 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  37.18 
 
 
1779 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 
597 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  37.06 
 
 
574 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  36.38 
 
 
3231 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 
555 aa  364  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 
706 aa  362  8e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  36.27 
 
 
606 aa  362  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  36.96 
 
 
6272 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  36.96 
 
 
6274 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  36.96 
 
 
6271 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 
1292 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0181  peptide synthetase NRPS5-4-3  36.97 
 
 
1005 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1588  AMP-binding domain-containing protein  36.97 
 
 
605 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.53 
 
 
629 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  36.97 
 
 
605 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.24 
 
 
629 aa  350  5e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  34.81 
 
 
622 aa  350  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 
636 aa  348  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 
701 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  37.43 
 
 
1981 aa  347  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.02 
 
 
629 aa  342  8e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.02 
 
 
629 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
684 aa  341  2e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.839841  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.02 
 
 
629 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  36.26 
 
 
3208 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  36.07 
 
 
593 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 
640 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 
551 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1459  AMP-binding domain-containing protein  35.51 
 
 
621 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0838  AMP-binding domain-containing protein  35.51 
 
 
621 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2154  AMP-binding domain-containing protein  35.51 
 
 
621 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1849  AMP-binding domain-containing protein  35.69 
 
 
621 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0427  AMP-binding enzyme  35.69 
 
 
621 aa  336  7.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>