More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6561 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
609 aa  1216    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  49.4 
 
 
610 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  49.4 
 
 
599 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  49.23 
 
 
599 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  49.23 
 
 
610 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  49.23 
 
 
599 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  49.23 
 
 
610 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.77 
 
 
1656 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  40.92 
 
 
2762 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  40.73 
 
 
2997 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  42.08 
 
 
602 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  40.9 
 
 
2791 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 
725 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 
725 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  42.48 
 
 
1067 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 
597 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 
597 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  40.6 
 
 
586 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  37.42 
 
 
614 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 
611 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  40.28 
 
 
2820 aa  390  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  38.23 
 
 
588 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 
596 aa  386  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  41.26 
 
 
6403 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  39.86 
 
 
579 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  42.58 
 
 
2103 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  40.77 
 
 
1474 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  42.27 
 
 
592 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  41.47 
 
 
578 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  36.74 
 
 
551 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  40.85 
 
 
706 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 
599 aa  361  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  41.05 
 
 
597 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  41.91 
 
 
2250 aa  357  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  39.51 
 
 
1753 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  41.08 
 
 
2721 aa  355  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  36.41 
 
 
991 aa  355  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  39.89 
 
 
4317 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  39.72 
 
 
4317 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  41.43 
 
 
4336 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  35.76 
 
 
581 aa  351  3e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  41.04 
 
 
1801 aa  349  8e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  35.07 
 
 
581 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  41.44 
 
 
4342 aa  347  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  39.82 
 
 
4332 aa  346  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  40.07 
 
 
606 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  40.18 
 
 
1776 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  39.18 
 
 
4317 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18360  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.89 
 
 
577 aa  343  5.999999999999999e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.03 
 
 
6889 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  41.79 
 
 
6272 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 
593 aa  340  2.9999999999999998e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  41.79 
 
 
6274 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  39.77 
 
 
4336 aa  339  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 
595 aa  340  7e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  41.6 
 
 
6271 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  40.87 
 
 
4342 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  39.57 
 
 
4317 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 
701 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  39.89 
 
 
3231 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  38.59 
 
 
3235 aa  331  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  37.93 
 
 
1272 aa  331  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  38.25 
 
 
574 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  41.95 
 
 
605 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  40.11 
 
 
1779 aa  329  8e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  41.17 
 
 
4318 aa  327  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0181  peptide synthetase NRPS5-4-3  41.11 
 
 
1005 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 
608 aa  326  8.000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1588  AMP-binding domain-containing protein  41.78 
 
 
605 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 
684 aa  323  7e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.839841  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  37.37 
 
 
576 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  37.99 
 
 
755 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  38.79 
 
 
1789 aa  316  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  38.24 
 
 
1323 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  40.28 
 
 
3208 aa  316  9.999999999999999e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  37.93 
 
 
1292 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  37.61 
 
 
1291 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  37.61 
 
 
1283 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  37.17 
 
 
559 aa  312  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  37.63 
 
 
1276 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  35.56 
 
 
601 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  35.56 
 
 
601 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  35.56 
 
 
601 aa  310  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  37.01 
 
 
622 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  36.94 
 
 
592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  37.29 
 
 
617 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  37.29 
 
 
617 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  37.63 
 
 
577 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  35.26 
 
 
1981 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  35.52 
 
 
592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  37.12 
 
 
617 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  37.24 
 
 
1699 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  35.93 
 
 
584 aa  302  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.2 
 
 
629 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  34.78 
 
 
583 aa  301  2e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  33 
 
 
738 aa  301  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  37 
 
 
4268 aa  300  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  34.7 
 
 
580 aa  300  5e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 
958 aa  300  7e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 
555 aa  299  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>