More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2453 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  100 
 
 		 588 aa  1233    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  45.7 
 
 		 725 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  45.7 
 
 		 725 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  43.79 
 
 		 1656 aa  534  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  46.88 
 
 		 2103 aa  525  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  45.6 
 
 		 2791 aa  520  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  43.16 
 
 		 2997 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  42.9 
 
 		 611 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  42.17 
 
 		 2762 aa  495  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 		 614 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  42.71 
 
 		 596 aa  480  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  42.25 
 
 		 1474 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  40.77 
 
 		 991 aa  469  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  40.21 
 
 		 597 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  40.21 
 
 		 597 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  43.09 
 
 		 2820 aa  455  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 		 602 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  39.37 
 
 		 1067 aa  450  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  42.17 
 
 		 586 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  41.14 
 
 		 592 aa  441  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  40.96 
 
 		 595 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  41.05 
 
 		 6403 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  40.32 
 
 		 579 aa  432  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.82 
 
 		 6889 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  39.86 
 
 		 2721 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  40.61 
 
 		 4336 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  40.77 
 
 		 4342 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  40.46 
 
 		 4342 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  40.29 
 
 		 4336 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  39.51 
 
 		 4332 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  39.49 
 
 		 4318 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  38.54 
 
 		 578 aa  404  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 608 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  38.69 
 
 		 1753 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  39.55 
 
 		 1291 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  39.55 
 
 		 1283 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 706 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  38.74 
 
 		 581 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  38.57 
 
 		 581 aa  395  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  39.69 
 
 		 1276 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  38.34 
 
 		 4317 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 		 1272 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  38.29 
 
 		 4317 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  39.69 
 
 		 610 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  39 
 
 		 4317 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  39.69 
 
 		 599 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  39.51 
 
 		 610 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  39.51 
 
 		 599 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  37.97 
 
 		 1323 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  39.07 
 
 		 4317 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 		 599 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  39.69 
 
 		 610 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  39.69 
 
 		 599 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  38.23 
 
 		 609 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  37.69 
 
 		 2250 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  38.07 
 
 		 1789 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  37.63 
 
 		 3235 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  37.48 
 
 		 1801 aa  379  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  36.12 
 
 		 755 aa  379  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 		 1292 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  39.38 
 
 		 1776 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  35.99 
 
 		 617 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  35.99 
 
 		 617 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  35.99 
 
 		 617 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 551 aa  365  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  35.48 
 
 		 620 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  37.31 
 
 		 3231 aa  362  8e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 582 aa  362  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 		 597 aa  360  5e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  39.19 
 
 		 574 aa  360  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  38.03 
 
 		 1699 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 701 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  35.65 
 
 		 1779 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  36.57 
 
 		 559 aa  345  2e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  36.57 
 
 		 564 aa  345  2e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  37.32 
 
 		 555 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  38.13 
 
 		 6274 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  38.13 
 
 		 6272 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  38.13 
 
 		 6271 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 593 aa  339  9e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 684 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.839841  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  34.8 
 
 		 605 aa  336  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  34.98 
 
 		 4268 aa  335  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0181  peptide synthetase NRPS5-4-3  34.91 
 
 		 1005 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1588  AMP-binding domain-containing protein  34.8 
 
 		 605 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  34.12 
 
 		 606 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  38.16 
 
 		 3208 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  34.82 
 
 		 578 aa  324  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  34.21 
 
 		 573 aa  322  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  33.5 
 
 		 636 aa  320  3e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  34.31 
 
 		 573 aa  319  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.73 
 
 		 629 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.73 
 
 		 629 aa  317  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 		 629 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  34.02 
 
 		 584 aa  316  8e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  32.95 
 
 		 738 aa  315  9.999999999999999e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  33.74 
 
 		 4165 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.97 
 
 		 629 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.62 
 
 		 629 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  34.48 
 
 		 601 aa  311  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>