More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3073 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 653 aa  1322    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  37.12 
 
 		 3235 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  38.46 
 
 		 7122 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  36.21 
 
 		 3718 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  36 
 
 		 2753 aa  405  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  39.46 
 
 		 3099 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  33.54 
 
 		 4101 aa  305  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 		 958 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 949 aa  294  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  35.85 
 
 		 1035 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 947 aa  279  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 962 aa  279  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 958 aa  278  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  35.82 
 
 		 942 aa  276  8e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2414  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 1818 aa  269  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 1419 aa  268  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.169022 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  31.87 
 
 		 755 aa  268  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  35.04 
 
 		 574 aa  266  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1011  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 		 1976 aa  264  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 584 aa  264  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 		 603 aa  263  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  31.73 
 
 		 852 aa  262  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  31.6 
 
 		 936 aa  262  1e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  36.24 
 
 		 563 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  35.48 
 
 		 576 aa  262  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  35.48 
 
 		 576 aa  261  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  35.48 
 
 		 573 aa  261  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  35.66 
 
 		 585 aa  259  9e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  35.29 
 
 		 576 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  35.29 
 
 		 573 aa  258  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  35.36 
 
 		 1779 aa  257  4e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  29.62 
 
 		 2681 aa  257  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 608 aa  256  8e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  30.37 
 
 		 581 aa  255  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.13 
 
 		 560 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  30.65 
 
 		 1801 aa  252  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  29.93 
 
 		 3374 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.95 
 
 		 562 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 839 aa  251  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  31.07 
 
 		 1067 aa  250  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  29.98 
 
 		 581 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  30.53 
 
 		 1656 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  39.74 
 
 		 613 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  34.23 
 
 		 2721 aa  248  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.87 
 
 		 4342 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  32 
 
 		 4318 aa  247  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.63 
 
 		 563 aa  248  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.09 
 
 		 4342 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  30.88 
 
 		 4317 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  39.5 
 
 		 580 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0198968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.47 
 
 		 2762 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.83 
 
 		 4317 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 586 aa  244  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  35.34 
 
 		 568 aa  243  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 579 aa  243  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  29.65 
 
 		 2791 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  33.57 
 
 		 601 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 534 aa  241  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 		 1789 aa  241  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  31.23 
 
 		 4317 aa  241  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 586 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 586 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  32.14 
 
 		 6403 aa  238  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 592 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  33.83 
 
 		 595 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  31.56 
 
 		 3235 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  30.79 
 
 		 1776 aa  238  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  32.69 
 
 		 3208 aa  236  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 		 593 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  28.61 
 
 		 2997 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 		 991 aa  236  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 706 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  31.46 
 
 		 4317 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  38.85 
 
 		 577 aa  233  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  32.28 
 
 		 559 aa  233  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  31.48 
 
 		 4336 aa  233  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 578 aa  232  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  34.47 
 
 		 593 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2049  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 		 547 aa  231  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.998714  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.59 
 
 		 4336 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 599 aa  230  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.56 
 
 		 629 aa  230  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 684 aa  230  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.839841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.71 
 
 		 4332 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.4 
 
 		 546 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 		 586 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 		 1272 aa  227  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 701 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  30.05 
 
 		 725 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  33.94 
 
 		 593 aa  225  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  30.05 
 
 		 725 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.43 
 
 		 544 aa  224  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  29.86 
 
 		 588 aa  224  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  32.21 
 
 		 3231 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  29.25 
 
 		 1753 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.24 
 
 		 629 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.24 
 
 		 629 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.24 
 
 		 629 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  31.5 
 
 		 2250 aa  224  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  31.72 
 
 		 1474 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>