More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2049 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2049  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 547 aa  1102    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.998714  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 		 580 aa  333  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0198968 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  40.59 
 
 		 534 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 648 aa  260  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 613 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  32.36 
 
 		 574 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 839 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  31.4 
 
 		 852 aa  238  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  32.06 
 
 		 936 aa  236  6e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 958 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  32.66 
 
 		 608 aa  232  1e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  34.39 
 
 		 1801 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 603 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  38.42 
 
 		 2250 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  31.29 
 
 		 576 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 653 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 610 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  31.41 
 
 		 585 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  36.53 
 
 		 2721 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  34.25 
 
 		 610 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  34.79 
 
 		 755 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  34.25 
 
 		 599 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 599 aa  217  5e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  34.25 
 
 		 599 aa  217  5e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 		 599 aa  216  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  31.24 
 
 		 576 aa  216  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 962 aa  216  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  34.65 
 
 		 610 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  31.03 
 
 		 576 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  31.24 
 
 		 573 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  31.03 
 
 		 573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 942 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  34.64 
 
 		 3208 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 563 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 		 584 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  32.42 
 
 		 601 aa  213  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  34.74 
 
 		 4318 aa  213  9e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  28.63 
 
 		 581 aa  211  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 958 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 949 aa  211  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  33.33 
 
 		 4317 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  29.04 
 
 		 581 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 577 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  33.15 
 
 		 1035 aa  207  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  33.02 
 
 		 1067 aa  207  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  32.48 
 
 		 4317 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  32.34 
 
 		 559 aa  205  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  37.58 
 
 		 606 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  36.67 
 
 		 1776 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  33.39 
 
 		 6403 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  38.08 
 
 		 1779 aa  203  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 586 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 947 aa  203  6e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  34.77 
 
 		 609 aa  203  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  32.74 
 
 		 1789 aa  202  9e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.82 
 
 		 4336 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.26 
 
 		 3235 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.48 
 
 		 4336 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  34.98 
 
 		 1699 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.69 
 
 		 4317 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 595 aa  200  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 		 578 aa  199  9e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  31.69 
 
 		 4317 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 596 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  32.23 
 
 		 3718 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  32.33 
 
 		 573 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 586 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 555 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  32.6 
 
 		 4332 aa  197  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 586 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  33.17 
 
 		 991 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.26 
 
 		 4342 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4912  amino acid adenylation domain protein  32.79 
 
 		 1715 aa  195  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.650159  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  31.61 
 
 		 619 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.61 
 
 		 2762 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  31.66 
 
 		 578 aa  193  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18360  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.33 
 
 		 577 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 		 636 aa  192  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  31.37 
 
 		 4342 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  29.77 
 
 		 7122 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 592 aa  190  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  32.42 
 
 		 1656 aa  190  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.2 
 
 		 3099 aa  190  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  31.01 
 
 		 1981 aa  189  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.69 
 
 		 2791 aa  189  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  31.8 
 
 		 573 aa  189  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.31 
 
 		 629 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  30.86 
 
 		 3231 aa  189  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  32.49 
 
 		 1474 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  32.04 
 
 		 2753 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.34 
 
 		 562 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.76 
 
 		 629 aa  187  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.7 
 
 		 544 aa  187  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4411  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  32.9 
 
 		 528 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 706 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>