More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1894 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  44.06 
 
 		 962 aa  713    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  39.87 
 
 		 936 aa  678    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  51.14 
 
 		 949 aa  838    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  40.85 
 
 		 852 aa  639    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  45.28 
 
 		 1035 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 947 aa  1906    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  49.63 
 
 		 958 aa  819    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  48.29 
 
 		 958 aa  808    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  48.4 
 
 		 942 aa  829    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  38.12 
 
 		 4317 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  37.94 
 
 		 4317 aa  326  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.74 
 
 		 4317 aa  326  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  38.23 
 
 		 4318 aa  323  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  38.24 
 
 		 1067 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  38.23 
 
 		 4317 aa  320  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  39 
 
 		 586 aa  319  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  36.11 
 
 		 2791 aa  317  6e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  37.69 
 
 		 4336 aa  317  8e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  38.19 
 
 		 4336 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.28 
 
 		 6889 aa  309  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  35.69 
 
 		 576 aa  308  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  35.69 
 
 		 573 aa  308  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  35.47 
 
 		 576 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 		 592 aa  306  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  35.97 
 
 		 563 aa  306  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.08 
 
 		 4342 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  37.14 
 
 		 4332 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  33.28 
 
 		 588 aa  305  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.38 
 
 		 4342 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  35.47 
 
 		 576 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  35.66 
 
 		 573 aa  304  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  34.64 
 
 		 3099 aa  302  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  34.4 
 
 		 2997 aa  300  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 725 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 725 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 586 aa  298  4e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  35.17 
 
 		 1789 aa  297  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 586 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  33.6 
 
 		 608 aa  296  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  35.19 
 
 		 1801 aa  296  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  34.98 
 
 		 1474 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  33.98 
 
 		 1656 aa  295  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 586 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.27 
 
 		 2762 aa  294  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 608 aa  291  4e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  36.81 
 
 		 1779 aa  291  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  36.71 
 
 		 2250 aa  290  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  34.34 
 
 		 2820 aa  290  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 603 aa  290  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 586 aa  290  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  35.39 
 
 		 3231 aa  289  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  37.43 
 
 		 609 aa  289  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 584 aa  289  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  34.51 
 
 		 1753 aa  288  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 		 577 aa  287  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  37.04 
 
 		 1776 aa  288  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 611 aa  287  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 		 602 aa  285  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 578 aa  283  7.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 1272 aa  281  4e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  33.81 
 
 		 574 aa  281  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 614 aa  281  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.03 
 
 		 6403 aa  280  8e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.87 
 
 		 3235 aa  280  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 		 579 aa  280  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  36.05 
 
 		 755 aa  278  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 		 595 aa  277  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  36.27 
 
 		 3208 aa  278  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 648 aa  276  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  33.62 
 
 		 738 aa  276  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.83 
 
 		 546 aa  274  5.000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 839 aa  274  6e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1828  AMP-dependent synthetase and ligase  29.93 
 
 		 576 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.397575  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 600 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  34.67 
 
 		 601 aa  273  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 600 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 600 aa  272  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 561 aa  270  8e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  33.39 
 
 		 599 aa  270  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 991 aa  270  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 551 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 653 aa  268  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  33.22 
 
 		 599 aa  267  7e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  33.22 
 
 		 599 aa  267  7e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 587 aa  267  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  33.22 
 
 		 610 aa  267  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  33.39 
 
 		 610 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  33.22 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 585 aa  266  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 597 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 1292 aa  266  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  31.34 
 
 		 581 aa  265  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  36.27 
 
 		 6272 aa  265  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  36.27 
 
 		 6274 aa  265  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 597 aa  265  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 596 aa  265  4.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  31.28 
 
 		 581 aa  263  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  36.08 
 
 		 6271 aa  263  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.19 
 
 		 544 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.19 
 
 		 544 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>