More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5325 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.95 
 
 
544 aa  798    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  82.14 
 
 
544 aa  892    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  81.77 
 
 
544 aa  895    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.45 
 
 
544 aa  1094    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4798  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.22 
 
 
544 aa  799    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.77 
 
 
544 aa  805    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.59 
 
 
544 aa  830    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
544 aa  1100    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.4 
 
 
544 aa  803    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.59 
 
 
544 aa  830    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
544 aa  1100    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.48 
 
 
560 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.66 
 
 
546 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.38 
 
 
563 aa  510  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.05 
 
 
562 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
949 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 
958 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  36.86 
 
 
947 aa  272  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4411  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.32 
 
 
528 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 
942 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 
962 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  35.59 
 
 
1035 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  33.14 
 
 
936 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 
958 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  32.75 
 
 
852 aa  264  3e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1723  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.8 
 
 
521 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1702  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.8 
 
 
521 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11665  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1770  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.12 
 
 
524 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0440023  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11375  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.38 
 
 
521 aa  259  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.763989  normal  0.42524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1945  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.78 
 
 
526 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2383  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.74 
 
 
535 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.962951  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2342  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.74 
 
 
535 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2389  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.74 
 
 
535 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265242  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 
577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
586 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 
584 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  38.07 
 
 
4317 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.91 
 
 
4317 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  37.82 
 
 
4317 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  37.4 
 
 
4317 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  32.38 
 
 
2791 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  31.57 
 
 
3099 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 
586 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  36.52 
 
 
1789 aa  216  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  34.83 
 
 
1067 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 
586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2748  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 
600 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 
586 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
603 aa  211  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  37.37 
 
 
3208 aa  209  7e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  37.32 
 
 
609 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 
653 aa  209  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 
586 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 
578 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  37.19 
 
 
1779 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.87 
 
 
1801 aa  207  6e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 
600 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 
600 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 
600 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 
599 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.18 
 
 
6403 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 
596 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  31.63 
 
 
574 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  32.28 
 
 
2997 aa  204  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.34 
 
 
4336 aa  204  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 
579 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  35.58 
 
 
576 aa  203  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  33.41 
 
 
563 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  31.85 
 
 
576 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  30.35 
 
 
581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  30.36 
 
 
581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  31.85 
 
 
573 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  38.08 
 
 
1699 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  30.96 
 
 
585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 
587 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 
613 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  35.22 
 
 
576 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  38.4 
 
 
4318 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.25 
 
 
4336 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.9 
 
 
2762 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  34.51 
 
 
568 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  35.1 
 
 
573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  35.61 
 
 
4342 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 
648 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  34.06 
 
 
1753 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  33.75 
 
 
701 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  35 
 
 
574 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  35.35 
 
 
4342 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 
594 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  33.74 
 
 
588 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 
592 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  35.56 
 
 
1474 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  33.5 
 
 
577 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  31.51 
 
 
1323 aa  194  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  33.5 
 
 
577 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  33.5 
 
 
577 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  33.33 
 
 
6889 aa  194  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17520  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.13 
 
 
559 aa  193  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  33.25 
 
 
635 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  33.25 
 
 
588 aa  193  7e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>