More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0734 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
561 aa  1149    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2748  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 
600 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 
947 aa  276  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 
962 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 
958 aa  257  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 
949 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3738  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 
519 aa  250  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  29.98 
 
 
936 aa  248  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  29.8 
 
 
852 aa  246  8e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  30.46 
 
 
958 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  31.55 
 
 
1067 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 
942 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  32.08 
 
 
1474 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  29.46 
 
 
608 aa  226  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  31.37 
 
 
588 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  31.68 
 
 
4336 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 
586 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
586 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  29.11 
 
 
2820 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 
597 aa  219  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 
991 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  29.04 
 
 
581 aa  219  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  29.04 
 
 
581 aa  217  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  31.85 
 
 
4342 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 
706 aa  217  5e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  32.5 
 
 
1699 aa  217  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  30 
 
 
576 aa  216  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  29.03 
 
 
576 aa  216  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  29.03 
 
 
573 aa  216  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 
593 aa  216  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  29.66 
 
 
1035 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  31.84 
 
 
586 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 
1272 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  30.37 
 
 
574 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  30.97 
 
 
4332 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 
586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.25 
 
 
2762 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  28.98 
 
 
576 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  28.55 
 
 
576 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  29.14 
 
 
563 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  30.68 
 
 
1776 aa  213  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  28.73 
 
 
573 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 
602 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.88 
 
 
1656 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  29.82 
 
 
1323 aa  212  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 
595 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  31 
 
 
3231 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  30.97 
 
 
4342 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  30.16 
 
 
4336 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 
546 aa  210  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  27.69 
 
 
597 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  27.69 
 
 
597 aa  210  7e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 
839 aa  209  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  30.05 
 
 
577 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 
600 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  29.63 
 
 
4317 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 
586 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 
600 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  30.9 
 
 
4317 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 
578 aa  207  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  30.44 
 
 
2250 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  29.56 
 
 
1291 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  29.56 
 
 
1276 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  26.06 
 
 
3099 aa  207  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  29.56 
 
 
1283 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  30.11 
 
 
4317 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  30.29 
 
 
4317 aa  207  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.89 
 
 
629 aa  206  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 
600 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 
587 aa  206  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  31.23 
 
 
609 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.44 
 
 
629 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.44 
 
 
629 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.44 
 
 
629 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 
1292 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.39 
 
 
629 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  29.42 
 
 
585 aa  200  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  29.71 
 
 
601 aa  199  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  30.52 
 
 
593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 
636 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 
577 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 
648 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 
653 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 
611 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  30.46 
 
 
1801 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  26.09 
 
 
594 aa  198  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 
640 aa  197  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  30.21 
 
 
610 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  28.44 
 
 
578 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  29.25 
 
 
6889 aa  196  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  30.34 
 
 
610 aa  196  9e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  30.34 
 
 
599 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.67 
 
 
637 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  30.34 
 
 
599 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  34.5 
 
 
1789 aa  196  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  30.34 
 
 
599 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  30.34 
 
 
610 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  29.84 
 
 
580 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  29.66 
 
 
580 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  29.66 
 
 
631 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>