More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2901 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  79.6 
 
 
593 aa  973    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  54.96 
 
 
636 aa  672    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  56.11 
 
 
640 aa  686    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  57.36 
 
 
620 aa  665    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3855  putative fatty-acid--CoA ligase  60.5 
 
 
605 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724696  hitchhiker  0.00746256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3869  putative fatty-acid--CoA ligase  60.34 
 
 
605 aa  670    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
593 aa  1201    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2966  putative fatty-acid--CoA ligase  58.15 
 
 
607 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.453521  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3943  putative fatty-acid--CoA ligase  60.34 
 
 
605 aa  670    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.082676  normal  0.0172927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.05 
 
 
629 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.05 
 
 
629 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.05 
 
 
629 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.39 
 
 
629 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.55 
 
 
637 aa  611  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.89 
 
 
629 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  44.25 
 
 
574 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  42 
 
 
597 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  42.27 
 
 
576 aa  412  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  42.49 
 
 
577 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  40.34 
 
 
619 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  41.7 
 
 
626 aa  397  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  40.1 
 
 
578 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  41.75 
 
 
592 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  41.08 
 
 
592 aa  387  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  42.27 
 
 
580 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  42.1 
 
 
580 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  42.1 
 
 
631 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  40.35 
 
 
580 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  39.93 
 
 
583 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  38.85 
 
 
573 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  40.14 
 
 
584 aa  367  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  39.9 
 
 
590 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  39.72 
 
 
590 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  39.72 
 
 
590 aa  362  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  39.19 
 
 
579 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  36.66 
 
 
2997 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
596 aa  349  9e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  36.14 
 
 
1067 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  37.73 
 
 
601 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  37.73 
 
 
601 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  38.94 
 
 
584 aa  346  7e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  37.73 
 
 
601 aa  345  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  38.75 
 
 
573 aa  345  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  37.63 
 
 
2103 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 
725 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 
725 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.03 
 
 
2762 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 
991 aa  338  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 
592 aa  336  5.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  35.25 
 
 
1656 aa  334  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  36.03 
 
 
2820 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  36.3 
 
 
595 aa  333  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.09 
 
 
4342 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 
597 aa  329  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 
597 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 
578 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 
582 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 
611 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  37.48 
 
 
2721 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.57 
 
 
4342 aa  323  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.74 
 
 
4332 aa  323  8e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 
608 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 
599 aa  321  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  36.53 
 
 
1474 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  37.07 
 
 
593 aa  320  5e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.11 
 
 
4336 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  33.57 
 
 
588 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  39.24 
 
 
2250 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 
614 aa  316  9e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  37.8 
 
 
1801 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 
586 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.98 
 
 
4336 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10409  acyl-CoA synthetase  37.24 
 
 
585 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.24 
 
 
6403 aa  314  2.9999999999999996e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 
602 aa  313  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  37.31 
 
 
3235 aa  312  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  37.28 
 
 
3231 aa  311  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  32.91 
 
 
581 aa  309  8e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  33.51 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  36.81 
 
 
2791 aa  307  3e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  37.93 
 
 
4165 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  36.72 
 
 
4318 aa  306  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  37.41 
 
 
1776 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  34.72 
 
 
4317 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.23 
 
 
4317 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  34.72 
 
 
4317 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  34.9 
 
 
4317 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  36.58 
 
 
1779 aa  302  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  34.52 
 
 
755 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  35.63 
 
 
6274 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  35.63 
 
 
6271 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  35.63 
 
 
6272 aa  300  5e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  35.36 
 
 
1753 aa  296  6e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  36.4 
 
 
3208 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  36.9 
 
 
609 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.06 
 
 
6889 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  35.83 
 
 
1699 aa  289  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 
701 aa  287  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  36.98 
 
 
610 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  37.04 
 
 
599 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>