More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6002 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  93.19 
 
 		 587 aa  1115    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  99.5 
 
 		 600 aa  1212    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 600 aa  1217    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  89.06 
 
 		 594 aa  1041    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 600 aa  1217    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  52.28 
 
 		 577 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  51.68 
 
 		 588 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  52.28 
 
 		 577 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  52.28 
 
 		 577 aa  542  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  51.5 
 
 		 635 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0718  AMP-binding domain-containing protein  51.5 
 
 		 686 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0642699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  51.5 
 
 		 588 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  30.29 
 
 		 936 aa  282  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  30.29 
 
 		 852 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 947 aa  275  3e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 958 aa  263  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 949 aa  259  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 962 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 958 aa  252  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  32.26 
 
 		 942 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  35.84 
 
 		 1035 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  32.17 
 
 		 2791 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  32.86 
 
 		 3231 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  35.58 
 
 		 3208 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 579 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 555 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 586 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  31.77 
 
 		 755 aa  229  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11375  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  37.1 
 
 		 521 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.763989  normal  0.42524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 613 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  34.01 
 
 		 2820 aa  227  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  33.58 
 
 		 559 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1702  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.17 
 
 		 521 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1723  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.17 
 
 		 521 aa  226  7e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1770  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.17 
 
 		 524 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0440023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 648 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  30.88 
 
 		 588 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  27.88 
 
 		 3718 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.7 
 
 		 1801 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  30.12 
 
 		 583 aa  220  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.33 
 
 		 6403 aa  220  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  34.59 
 
 		 1789 aa  220  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 701 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  32.61 
 
 		 1067 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  28.9 
 
 		 581 aa  219  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  28.5 
 
 		 581 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 		 551 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  32.48 
 
 		 2997 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  30.93 
 
 		 608 aa  217  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.53 
 
 		 544 aa  217  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 586 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.82 
 
 		 4342 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  32.39 
 
 		 4336 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 586 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  31.99 
 
 		 4317 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  29.49 
 
 		 576 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  29.75 
 
 		 573 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  31.19 
 
 		 4317 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 608 aa  213  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 		 586 aa  213  7e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4411  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  36.66 
 
 		 528 aa  213  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 592 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  32.04 
 
 		 1753 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.39 
 
 		 563 aa  212  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 839 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  28.5 
 
 		 7122 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  31.21 
 
 		 4317 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  29.61 
 
 		 584 aa  211  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  29.88 
 
 		 563 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  32.57 
 
 		 3235 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  26.85 
 
 		 3099 aa  211  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1828  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 		 576 aa  211  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.397575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 653 aa  210  7e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 1272 aa  210  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  32.88 
 
 		 609 aa  210  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.44 
 
 		 562 aa  209  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  29.94 
 
 		 574 aa  209  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 577 aa  208  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 		 546 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  31.56 
 
 		 601 aa  208  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36 
 
 		 544 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  29.27 
 
 		 576 aa  208  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  32.28 
 
 		 4342 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  32.19 
 
 		 4336 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.18 
 
 		 4332 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2342  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.76 
 
 		 535 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2383  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.76 
 
 		 535 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.962951  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2389  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.76 
 
 		 535 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  31.31 
 
 		 617 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.32 
 
 		 560 aa  207  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  29.53 
 
 		 573 aa  207  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  30.89 
 
 		 4317 aa  207  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 		 640 aa  207  6e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 586 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 595 aa  206  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.75 
 
 		 544 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.75 
 
 		 544 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  31.32 
 
 		 1776 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  29.61 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1945  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.86 
 
 		 526 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>