More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11375 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1945  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  62.17 
 
 
526 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11375  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  100 
 
 
521 aa  1032    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.763989  normal  0.42524 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4411  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  60.69 
 
 
528 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2342  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  63.1 
 
 
535 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2383  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  63.1 
 
 
535 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.962951  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2389  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  63.1 
 
 
535 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265242  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1770  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  60.42 
 
 
524 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0440023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1702  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  60.38 
 
 
521 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11665  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1723  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  60.38 
 
 
521 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.94 
 
 
544 aa  257  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.61 
 
 
546 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.87 
 
 
544 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.14 
 
 
560 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.55 
 
 
544 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.55 
 
 
544 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.48 
 
 
562 aa  252  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.09 
 
 
544 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.16 
 
 
544 aa  249  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4798  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.96 
 
 
544 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.5 
 
 
544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.5 
 
 
544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.44 
 
 
544 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.56 
 
 
544 aa  237  4e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 
600 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.44 
 
 
563 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 
600 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 
600 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  40.25 
 
 
587 aa  228  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 
594 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  31.52 
 
 
936 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  38.68 
 
 
949 aa  220  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  31.31 
 
 
852 aa  219  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 
958 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 
947 aa  213  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 
586 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 
958 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  37.37 
 
 
635 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  37.37 
 
 
588 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  38.87 
 
 
1035 aa  203  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
942 aa  202  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0718  AMP-binding domain-containing protein  37.37 
 
 
686 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0642699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  37.12 
 
 
588 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  37.12 
 
 
577 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  37.12 
 
 
577 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  37.12 
 
 
577 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 
603 aa  200  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 
577 aa  199  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 
962 aa  197  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  30.64 
 
 
576 aa  194  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  30.64 
 
 
573 aa  194  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 
584 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.36 
 
 
4317 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
586 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  35.34 
 
 
563 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  35.09 
 
 
576 aa  191  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 
586 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  31.57 
 
 
576 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  35.24 
 
 
2250 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  35.75 
 
 
4317 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  35.51 
 
 
2820 aa  189  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
648 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  34.62 
 
 
1801 aa  187  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  34.16 
 
 
608 aa  187  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  35.84 
 
 
4332 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  35.25 
 
 
4317 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  34.67 
 
 
573 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  35 
 
 
4317 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  30.35 
 
 
6889 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  32.74 
 
 
7122 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  35.18 
 
 
1789 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 
613 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  34.83 
 
 
1776 aa  184  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4912  amino acid adenylation domain protein  37.53 
 
 
1715 aa  183  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.650159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
653 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2049  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
547 aa  182  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.998714  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  34.88 
 
 
568 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  34.74 
 
 
1699 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 
586 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36 
 
 
4342 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 
579 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  35.98 
 
 
4342 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  33.08 
 
 
2997 aa  176  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  34.49 
 
 
4336 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1828  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 
576 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.397575  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  35.78 
 
 
1779 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  31.84 
 
 
1067 aa  173  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.59 
 
 
4336 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.57 
 
 
2791 aa  172  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  30.65 
 
 
585 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  30.08 
 
 
1753 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  32.51 
 
 
3231 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  31.58 
 
 
1323 aa  171  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 
1272 aa  170  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 
580 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0198968 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  32.16 
 
 
1474 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.86 
 
 
1656 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  30.17 
 
 
573 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  31.41 
 
 
3718 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  31.87 
 
 
590 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  31.87 
 
 
590 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>