More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2880 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  99.83 
 
 
588 aa  1167    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
577 aa  1168    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0718  AMP-binding domain-containing protein  99.31 
 
 
686 aa  1159    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0642699  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  99.48 
 
 
588 aa  1162    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
577 aa  1168    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
577 aa  1168    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  99.13 
 
 
635 aa  1160    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  52.28 
 
 
600 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  52.28 
 
 
600 aa  548  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  52.28 
 
 
600 aa  548  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  50.54 
 
 
587 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  51.52 
 
 
594 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  30.71 
 
 
936 aa  251  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  30.54 
 
 
852 aa  249  9e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  33.75 
 
 
958 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  32.91 
 
 
2820 aa  243  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
949 aa  243  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 
958 aa  240  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 
579 aa  236  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 
962 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  32.3 
 
 
2791 aa  234  5e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3423  acyl-CoA synthetase  30.41 
 
 
601 aa  233  7.000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 
586 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  31.38 
 
 
563 aa  231  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 
942 aa  231  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  31.04 
 
 
576 aa  230  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  30.87 
 
 
573 aa  229  9e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  30.87 
 
 
576 aa  229  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  31.37 
 
 
573 aa  228  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  31.39 
 
 
3231 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  33.74 
 
 
3208 aa  227  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 
648 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 
614 aa  226  8e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 
613 aa  226  8e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  32 
 
 
4317 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  30.56 
 
 
576 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  32.18 
 
 
4317 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  33.58 
 
 
609 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 
586 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 
586 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
603 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  33.1 
 
 
586 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  32.07 
 
 
4317 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  35.5 
 
 
610 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  29.24 
 
 
3718 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  31.86 
 
 
755 aa  221  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
1035 aa  220  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 
551 aa  219  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  29.6 
 
 
581 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 
578 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 
584 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  29.44 
 
 
581 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.92 
 
 
6403 aa  219  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.16 
 
 
4342 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  35.33 
 
 
599 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.55 
 
 
4317 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  35.21 
 
 
610 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  35.15 
 
 
599 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  35.15 
 
 
599 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 
555 aa  216  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  35.15 
 
 
610 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  29.81 
 
 
947 aa  216  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  29.85 
 
 
574 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  32.16 
 
 
4342 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  32.52 
 
 
3235 aa  213  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  29.75 
 
 
2997 aa  213  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  31.03 
 
 
1753 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  30.13 
 
 
608 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
586 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 
839 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  28.96 
 
 
619 aa  210  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  32.76 
 
 
617 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  31.34 
 
 
559 aa  210  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  32.55 
 
 
4318 aa  209  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 
706 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
606 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.7 
 
 
544 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11375  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  37.12 
 
 
521 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.763989  normal  0.42524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  31.94 
 
 
1801 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  30.36 
 
 
585 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  28.42 
 
 
7122 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 
534 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  30.12 
 
 
4332 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
653 aa  207  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.73 
 
 
2762 aa  207  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.99 
 
 
563 aa  206  8e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.6 
 
 
3099 aa  206  8e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.61 
 
 
544 aa  206  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.43 
 
 
560 aa  206  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  32.25 
 
 
617 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
577 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  31.42 
 
 
1323 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  29.04 
 
 
584 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.56 
 
 
544 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  32.25 
 
 
617 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.56 
 
 
544 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  32.77 
 
 
1779 aa  205  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.79 
 
 
544 aa  205  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.56 
 
 
544 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  30.34 
 
 
602 aa  204  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>