More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4347 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 544 aa  1107    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  72.24 
 
 		 544 aa  799    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4798  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  93.57 
 
 		 544 aa  1024    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  73.71 
 
 		 544 aa  810    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.59 
 
 		 544 aa  806    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.59 
 
 		 544 aa  805    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.82 
 
 		 544 aa  1105    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  89.52 
 
 		 544 aa  976    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  92.83 
 
 		 544 aa  1020    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 544 aa  1107    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  74.59 
 
 		 544 aa  806    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.9 
 
 		 560 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.76 
 
 		 546 aa  568  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.83 
 
 		 563 aa  530  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.8 
 
 		 562 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 958 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 962 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4411  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.62 
 
 		 528 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  34.87 
 
 		 1035 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 949 aa  262  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  32.43 
 
 		 936 aa  261  3e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1945  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.37 
 
 		 526 aa  258  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  32.05 
 
 		 852 aa  256  6e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 942 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1770  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.66 
 
 		 524 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0440023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1702  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.66 
 
 		 521 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.11665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1723  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  35.66 
 
 		 521 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 947 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 958 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11375  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  34.5 
 
 		 521 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.763989  normal  0.42524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 		 577 aa  239  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2342  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.2 
 
 		 535 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2383  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.2 
 
 		 535 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.962951  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2389  long-chain-fatty-acid--[acyl-carrier-protein] ligase  33.2 
 
 		 535 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  34.08 
 
 		 3099 aa  229  8e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  34.28 
 
 		 1789 aa  229  8e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  32.2 
 
 		 574 aa  226  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  32.89 
 
 		 4317 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  31.82 
 
 		 4317 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 586 aa  220  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  31.67 
 
 		 4317 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 584 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  32 
 
 		 1067 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.13 
 
 		 2791 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 613 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 586 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  36.04 
 
 		 4317 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 586 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  35.16 
 
 		 1699 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 586 aa  213  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  31.15 
 
 		 585 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 596 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 603 aa  212  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 648 aa  212  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  31.41 
 
 		 2762 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.36 
 
 		 1801 aa  210  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 		 578 aa  210  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  31.94 
 
 		 2997 aa  210  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  31.23 
 
 		 576 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  32.97 
 
 		 576 aa  209  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  31.23 
 
 		 573 aa  209  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  31.51 
 
 		 1291 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  31.51 
 
 		 1283 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  31.75 
 
 		 576 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  31.51 
 
 		 1276 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 839 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 1323 aa  207  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  32.69 
 
 		 563 aa  207  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 701 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 579 aa  206  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.09 
 
 		 6403 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  32.54 
 
 		 573 aa  205  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 653 aa  205  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 599 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  36.83 
 
 		 609 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.58 
 
 		 6889 aa  203  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  36.19 
 
 		 1779 aa  203  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  31.31 
 
 		 568 aa  203  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  32.66 
 
 		 2721 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  33.56 
 
 		 588 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  33.56 
 
 		 577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  33.56 
 
 		 577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  33.56 
 
 		 577 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  36.14 
 
 		 1474 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 586 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 588 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  29.23 
 
 		 1656 aa  200  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 635 aa  200  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  29.08 
 
 		 581 aa  200  6e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.15 
 
 		 4332 aa  200  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  35.25 
 
 		 1776 aa  199  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0718  AMP-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 686 aa  199  9e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0642699  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 1272 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  28.68 
 
 		 581 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 611 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  33 
 
 		 622 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  31.07 
 
 		 4336 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4912  amino acid adenylation domain protein  36.06 
 
 		 1715 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.650159  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  34.06 
 
 		 2250 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  35.63 
 
 		 3235 aa  194  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>