More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3282 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 534 aa  1069    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  47.93 
 
 		 580 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0198968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 		 613 aa  339  9e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2049  AMP-dependent synthetase and ligase  40.59 
 
 		 547 aa  330  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.998714  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  40.54 
 
 		 648 aa  310  5e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  37.62 
 
 		 1067 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  41 
 
 		 653 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  35.96 
 
 		 755 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  33.72 
 
 		 1801 aa  226  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 		 579 aa  226  9e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 839 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  35.28 
 
 		 599 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  35.28 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  35.28 
 
 		 599 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  35.28 
 
 		 599 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 958 aa  224  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  35.28 
 
 		 610 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 586 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  35.1 
 
 		 610 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  31.1 
 
 		 936 aa  222  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 949 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  30.89 
 
 		 852 aa  221  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  35.49 
 
 		 555 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  36.77 
 
 		 2721 aa  220  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0231  acyl-CoA synthetase  32.6 
 
 		 608 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  31.97 
 
 		 1789 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  31.26 
 
 		 581 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  30.87 
 
 		 581 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  35.89 
 
 		 3235 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 603 aa  216  7e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  34.56 
 
 		 593 aa  216  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 947 aa  216  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  34.34 
 
 		 559 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 584 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  34.33 
 
 		 2791 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  32.06 
 
 		 585 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 595 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  32.43 
 
 		 573 aa  213  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  32.43 
 
 		 576 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  32.94 
 
 		 576 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  33.66 
 
 		 563 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 596 aa  213  9e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  32.94 
 
 		 573 aa  213  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  35.36 
 
 		 1779 aa  213  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  32.74 
 
 		 576 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  34.46 
 
 		 4317 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  31.69 
 
 		 588 aa  212  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 684 aa  212  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.839841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.19 
 
 		 1656 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 962 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  35.25 
 
 		 4318 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  32.17 
 
 		 7122 aa  211  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  31.89 
 
 		 2997 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 991 aa  208  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  33.47 
 
 		 4336 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  35.32 
 
 		 2250 aa  208  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17520  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.33 
 
 		 559 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 587 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  32.7 
 
 		 574 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 611 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33.78 
 
 		 4317 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  33.4 
 
 		 4336 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 725 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 578 aa  204  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  34.26 
 
 		 4317 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  34.66 
 
 		 4317 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  32.88 
 
 		 2820 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 725 aa  204  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  33.93 
 
 		 1776 aa  202  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 635 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 588 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0718  AMP-binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 686 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0642699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 942 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  35.87 
 
 		 3208 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  37.06 
 
 		 588 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  37.06 
 
 		 577 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 594 aa  200  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  37.06 
 
 		 577 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  37.06 
 
 		 577 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  34.72 
 
 		 4165 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.14 
 
 		 2762 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  32.52 
 
 		 3235 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 599 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  33.07 
 
 		 4332 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  32.53 
 
 		 1035 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  38.31 
 
 		 6403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 706 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 586 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 636 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.93 
 
 		 4342 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 608 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  34.71 
 
 		 1981 aa  194  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 614 aa  193  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4912  amino acid adenylation domain protein  37.88 
 
 		 1715 aa  194  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.650159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.55 
 
 		 3099 aa  193  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.86 
 
 		 563 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  32.84 
 
 		 593 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>