More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17520 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_17520  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  100 
 
 		 559 aa  1142    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.3 
 
 		 4336 aa  312  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  35.69 
 
 		 4317 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  35.85 
 
 		 4317 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  35.89 
 
 		 4332 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  35.39 
 
 		 1656 aa  309  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.94 
 
 		 4336 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  35.96 
 
 		 4317 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  34.53 
 
 		 4342 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.21 
 
 		 4317 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.66 
 
 		 2762 aa  297  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  33.51 
 
 		 2997 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  34.71 
 
 		 4318 aa  290  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  34.66 
 
 		 4342 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  34.96 
 
 		 2791 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.13 
 
 		 3231 aa  289  9e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 602 aa  289  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  35.82 
 
 		 1067 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  36.03 
 
 		 3208 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  34.4 
 
 		 1801 aa  282  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 		 725 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 		 725 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  34.73 
 
 		 2103 aa  280  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  34.44 
 
 		 1779 aa  279  9e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 597 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 597 aa  279  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  33.99 
 
 		 1789 aa  277  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  33.27 
 
 		 2721 aa  277  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 611 aa  276  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 595 aa  276  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  35.19 
 
 		 609 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 610 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 596 aa  274  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  32.99 
 
 		 1753 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 599 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  33.09 
 
 		 1474 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.97 
 
 		 6403 aa  272  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 		 706 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  35.8 
 
 		 1699 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  32.13 
 
 		 559 aa  271  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 610 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  32.13 
 
 		 564 aa  271  2.9999999999999997e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  30.9 
 
 		 581 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  31.06 
 
 		 581 aa  270  5e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 599 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 610 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 599 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  34.17 
 
 		 3235 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  34.75 
 
 		 1776 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 578 aa  268  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  31.28 
 
 		 755 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  33.82 
 
 		 2820 aa  268  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 620 aa  267  4e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 		 1272 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 614 aa  266  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  34.96 
 
 		 1323 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 701 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  33.63 
 
 		 617 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  33.63 
 
 		 617 aa  263  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 991 aa  263  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  33.22 
 
 		 593 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 608 aa  260  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  33.1 
 
 		 593 aa  259  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 		 629 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  32.92 
 
 		 620 aa  259  9e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 		 629 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.57 
 
 		 629 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 		 1291 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  34.46 
 
 		 1283 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  34.46 
 
 		 1276 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  33.27 
 
 		 617 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 555 aa  257  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18360  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.58 
 
 		 577 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 599 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  33.21 
 
 		 583 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 593 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 592 aa  253  6e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  32.62 
 
 		 601 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  32.62 
 
 		 601 aa  253  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.46 
 
 		 6889 aa  252  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.38 
 
 		 629 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  32.62 
 
 		 601 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.86 
 
 		 629 aa  250  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  31.85 
 
 		 2250 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 597 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  33.64 
 
 		 578 aa  247  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  31.49 
 
 		 588 aa  246  8e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 1292 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 636 aa  245  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 582 aa  244  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  32.32 
 
 		 574 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 958 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  32.72 
 
 		 584 aa  243  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 574 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  32.71 
 
 		 622 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 947 aa  239  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  32.87 
 
 		 1981 aa  239  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  31.51 
 
 		 738 aa  238  2e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>