More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4860 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 582 aa  1129    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  42.31 
 
 		 574 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.68 
 
 		 1656 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  35.51 
 
 		 588 aa  362  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  39.1 
 
 		 1067 aa  361  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 725 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  34.53 
 
 		 725 aa  356  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  39.58 
 
 		 1474 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  38.19 
 
 		 2791 aa  353  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.13 
 
 		 2762 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  36.9 
 
 		 619 aa  352  8e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 611 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  37.44 
 
 		 601 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  37.44 
 
 		 601 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  35.62 
 
 		 2997 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  37.19 
 
 		 576 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  40.3 
 
 		 755 aa  343  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 		 597 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 		 597 aa  342  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  35.46 
 
 		 583 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  37.26 
 
 		 601 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  39.38 
 
 		 590 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  39.38 
 
 		 590 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  37.12 
 
 		 1753 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 		 578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 991 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  35.57 
 
 		 578 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  39.31 
 
 		 590 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  36.77 
 
 		 2820 aa  336  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.47 
 
 		 629 aa  336  7e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  36.93 
 
 		 592 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  36.3 
 
 		 584 aa  333  6e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  38.77 
 
 		 631 aa  333  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  38.77 
 
 		 580 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37 
 
 		 629 aa  332  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  36.52 
 
 		 626 aa  331  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  37.01 
 
 		 580 aa  332  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  38.49 
 
 		 580 aa  330  3e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  39.27 
 
 		 2721 aa  330  5.0000000000000004e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 596 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37 
 
 		 629 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37 
 
 		 629 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37 
 
 		 629 aa  327  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  36.21 
 
 		 584 aa  325  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 608 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 602 aa  324  3e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  35.06 
 
 		 592 aa  324  3e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 586 aa  323  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 		 636 aa  322  9.999999999999999e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 614 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  31.34 
 
 		 581 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  36.24 
 
 		 573 aa  319  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  36.33 
 
 		 573 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  39.75 
 
 		 1779 aa  319  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  32.02 
 
 		 581 aa  318  3e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 640 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  36.35 
 
 		 577 aa  316  7e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  37.23 
 
 		 593 aa  316  8e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  38.37 
 
 		 592 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 		 2103 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  35.01 
 
 		 1801 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.07 
 
 		 4317 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  36.6 
 
 		 610 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  37.45 
 
 		 6403 aa  311  2e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  37.3 
 
 		 4317 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  37.57 
 
 		 4336 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  38.88 
 
 		 593 aa  311  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  37.39 
 
 		 4336 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  37.68 
 
 		 4317 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.95 
 
 		 6889 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  36.43 
 
 		 599 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  36.32 
 
 		 610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  36.14 
 
 		 610 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  36.14 
 
 		 599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  36.14 
 
 		 599 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.52 
 
 		 4332 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  38.69 
 
 		 4317 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  37.48 
 
 		 1283 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 701 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  37.48 
 
 		 1291 aa  306  7e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  36.22 
 
 		 1789 aa  306  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.31 
 
 		 637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  39.54 
 
 		 2250 aa  304  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  37.39 
 
 		 1276 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  39.58 
 
 		 4318 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  39.18 
 
 		 606 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  37.32 
 
 		 4268 aa  300  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  37.35 
 
 		 1323 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 706 aa  296  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 595 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 		 599 aa  296  9e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 551 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  40.24 
 
 		 605 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  37.3 
 
 		 617 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1588  AMP-binding domain-containing protein  40.24 
 
 		 605 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  37.3 
 
 		 617 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  39.45 
 
 		 3208 aa  294  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  39.29 
 
 		 3235 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>