More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3396 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  91.89 
 
 		 592 aa  1126    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  60.54 
 
 		 576 aa  740    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  58.05 
 
 		 580 aa  687    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  55.37 
 
 		 584 aa  643    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  59.97 
 
 		 577 aa  702    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  61.66 
 
 		 626 aa  733    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  59.39 
 
 		 619 aa  699    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  56.08 
 
 		 584 aa  646    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  61.63 
 
 		 580 aa  715    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  54.97 
 
 		 601 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  61.53 
 
 		 580 aa  712    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 592 aa  1209    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  56.73 
 
 		 578 aa  667    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  54.99 
 
 		 583 aa  646    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  54.97 
 
 		 601 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  61.69 
 
 		 631 aa  716    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  54.97 
 
 		 601 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  54.02 
 
 		 573 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  54.64 
 
 		 573 aa  618  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  52.38 
 
 		 590 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  52.38 
 
 		 590 aa  618  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  52.38 
 
 		 590 aa  618  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10409  acyl-CoA synthetase  43.93 
 
 		 585 aa  478  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  40.98 
 
 		 593 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 597 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  40.66 
 
 		 574 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  39.27 
 
 		 620 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  41.08 
 
 		 593 aa  364  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 		 636 aa  364  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.47 
 
 		 629 aa  362  9e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 640 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.98 
 
 		 629 aa  351  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.19 
 
 		 637 aa  351  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2966  putative fatty-acid--CoA ligase  39.12 
 
 		 607 aa  350  4e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.453521  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3869  putative fatty-acid--CoA ligase  38.75 
 
 		 605 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3943  putative fatty-acid--CoA ligase  38.75 
 
 		 605 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.082676  normal  0.0172927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.15 
 
 		 629 aa  343  7e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.15 
 
 		 629 aa  343  7e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3855  putative fatty-acid--CoA ligase  38.93 
 
 		 605 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724696  hitchhiker  0.00746256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.15 
 
 		 629 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.2 
 
 		 1656 aa  340  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  37.44 
 
 		 578 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 		 582 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  36.21 
 
 		 1067 aa  335  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  34.92 
 
 		 2997 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 599 aa  324  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 579 aa  323  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  35.88 
 
 		 4317 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.22 
 
 		 4317 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  35.53 
 
 		 4317 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  35.94 
 
 		 4332 aa  317  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 725 aa  317  6e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 725 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 596 aa  314  2.9999999999999996e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  36.39 
 
 		 4317 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 602 aa  310  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  36.94 
 
 		 609 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  36.66 
 
 		 4318 aa  307  3e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 608 aa  307  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 611 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.91 
 
 		 2762 aa  303  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 597 aa  303  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  33.05 
 
 		 581 aa  302  9e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  37.58 
 
 		 2250 aa  302  9e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  33.05 
 
 		 581 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  34.83 
 
 		 1801 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  36.25 
 
 		 3235 aa  301  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  36.35 
 
 		 617 aa  297  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  36.35 
 
 		 617 aa  297  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  34.56 
 
 		 4342 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  36.17 
 
 		 617 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 592 aa  296  9e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.51 
 
 		 4336 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  35.67 
 
 		 620 aa  295  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  35.71 
 
 		 4336 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  36.15 
 
 		 2721 aa  293  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  34.95 
 
 		 2791 aa  293  6e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 614 aa  293  6e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  34.74 
 
 		 4342 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  35.09 
 
 		 3231 aa  293  8e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  33.84 
 
 		 1474 aa  290  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.03 
 
 		 6403 aa  289  1e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  32.88 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  35.1 
 
 		 6889 aa  287  4e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 593 aa  287  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  32.72 
 
 		 755 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 991 aa  286  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 595 aa  286  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 		 706 aa  286  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 586 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  34.12 
 
 		 2103 aa  281  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  34.22 
 
 		 1779 aa  280  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  29.93 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  29.55 
 
 		 559 aa  278  3e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  34.6 
 
 		 3208 aa  277  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 610 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  34.6 
 
 		 1981 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  33.56 
 
 		 2820 aa  273  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  33.39 
 
 		 610 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>