More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2966 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  58.56 
 
 
593 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2966  putative fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
607 aa  1214    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.453521  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  58.15 
 
 
593 aa  648    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3869  putative fatty-acid--CoA ligase  70.43 
 
 
605 aa  810    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3855  putative fatty-acid--CoA ligase  70.6 
 
 
605 aa  811    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724696  hitchhiker  0.00746256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  68.61 
 
 
620 aa  838    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3943  putative fatty-acid--CoA ligase  70.43 
 
 
605 aa  810    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.082676  normal  0.0172927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  47.35 
 
 
640 aa  578  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  47.65 
 
 
636 aa  560  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.8 
 
 
629 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.65 
 
 
629 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.48 
 
 
629 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.48 
 
 
629 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.48 
 
 
629 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.56 
 
 
637 aa  504  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  43.23 
 
 
574 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  41.07 
 
 
597 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  40.14 
 
 
592 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  37.59 
 
 
619 aa  362  8e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  39.29 
 
 
592 aa  359  7e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  38.1 
 
 
578 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  38.21 
 
 
626 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  36.52 
 
 
573 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  37.48 
 
 
580 aa  336  9e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  36.71 
 
 
601 aa  334  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  36.71 
 
 
601 aa  334  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  36.71 
 
 
601 aa  333  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  36.59 
 
 
576 aa  333  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  35.59 
 
 
584 aa  331  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  36.68 
 
 
1067 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  39.12 
 
 
580 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  38.95 
 
 
580 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  38.95 
 
 
631 aa  325  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 
596 aa  324  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  36.94 
 
 
584 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  38.39 
 
 
577 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  35.38 
 
 
1656 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  36.27 
 
 
583 aa  317  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  36.54 
 
 
573 aa  316  8e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  34.58 
 
 
2997 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  35.65 
 
 
590 aa  309  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  35.65 
 
 
590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  35.65 
 
 
590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.02 
 
 
2762 aa  306  6e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.12 
 
 
4342 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.01 
 
 
4332 aa  300  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 
595 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 
579 aa  298  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
614 aa  294  4e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 
586 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  35.6 
 
 
4317 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 
725 aa  290  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  35.88 
 
 
4342 aa  290  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 
592 aa  289  9e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.48 
 
 
4336 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 
725 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  36.05 
 
 
4317 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  34.64 
 
 
4317 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  36.16 
 
 
2721 aa  287  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  34.98 
 
 
4317 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 
611 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 
991 aa  284  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 
597 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 
597 aa  283  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10409  acyl-CoA synthetase  34.8 
 
 
585 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  35.76 
 
 
4336 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  35.9 
 
 
4318 aa  281  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  37.01 
 
 
2250 aa  281  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  35.48 
 
 
2103 aa  280  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  33.16 
 
 
2820 aa  280  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 
599 aa  278  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  32.42 
 
 
581 aa  277  4e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 
582 aa  277  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 
578 aa  277  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  35.63 
 
 
3235 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 
608 aa  274  3e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  32.6 
 
 
581 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  34.66 
 
 
2791 aa  273  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 
602 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  31.78 
 
 
588 aa  269  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  35.66 
 
 
1801 aa  269  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  35.76 
 
 
610 aa  266  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  35.76 
 
 
599 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  35.76 
 
 
610 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  33.39 
 
 
755 aa  264  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.35 
 
 
3231 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  35.54 
 
 
599 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  35.54 
 
 
599 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  35.54 
 
 
610 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.18 
 
 
6403 aa  260  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  35.99 
 
 
1776 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
593 aa  257  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  37.12 
 
 
3208 aa  257  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  33.51 
 
 
6274 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  33.51 
 
 
6272 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  33.51 
 
 
6271 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  33.64 
 
 
1474 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  34.76 
 
 
1789 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 
706 aa  251  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 
1272 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>