More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3943 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  60.34 
 
 		 593 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  68.56 
 
 		 620 aa  840    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3855  putative fatty-acid--CoA ligase  98.84 
 
 		 605 aa  1199    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724696  hitchhiker  0.00746256 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3869  putative fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 605 aa  1209    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3943  putative fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 605 aa  1209    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.082676  normal  0.0172927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2966  putative fatty-acid--CoA ligase  70.43 
 
 		 607 aa  815    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.453521  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  59.4 
 
 		 593 aa  702    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  49.92 
 
 		 640 aa  612  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  50.41 
 
 		 636 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.8 
 
 		 637 aa  545  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.56 
 
 		 629 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.56 
 
 		 629 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.56 
 
 		 629 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.99 
 
 		 629 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.72 
 
 		 629 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  43.48 
 
 		 574 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  41.61 
 
 		 597 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  39.41 
 
 		 592 aa  369  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  38.78 
 
 		 578 aa  365  2e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  38.49 
 
 		 619 aa  362  8e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  38.89 
 
 		 573 aa  360  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  39.9 
 
 		 626 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  40.14 
 
 		 576 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  39.27 
 
 		 592 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  39.83 
 
 		 577 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  41.2 
 
 		 580 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  41.03 
 
 		 631 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  41.03 
 
 		 580 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  37.12 
 
 		 584 aa  348  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  37.94 
 
 		 580 aa  345  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 601 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 601 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 601 aa  343  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  36.49 
 
 		 1067 aa  343  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  38.23 
 
 		 590 aa  339  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  38.05 
 
 		 590 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  38.05 
 
 		 590 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  33.85 
 
 		 2997 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  38.11 
 
 		 583 aa  336  7e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  37.87 
 
 		 584 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.19 
 
 		 2762 aa  334  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  37.83 
 
 		 573 aa  331  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  35.07 
 
 		 1656 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 595 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 596 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 579 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 		 611 aa  316  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  34.97 
 
 		 2820 aa  315  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  37.33 
 
 		 2103 aa  310  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 		 725 aa  309  8e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 		 725 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  33.56 
 
 		 991 aa  308  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  38.09 
 
 		 2721 aa  306  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  37.61 
 
 		 2250 aa  304  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 593 aa  303  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  33.1 
 
 		 588 aa  303  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 614 aa  300  5e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10409  acyl-CoA synthetase  36.32 
 
 		 585 aa  297  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  35.4 
 
 		 4332 aa  296  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.59 
 
 		 4317 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  36.1 
 
 		 2791 aa  292  1e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 582 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  36.49 
 
 		 3235 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.53 
 
 		 1801 aa  291  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 578 aa  290  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  35.19 
 
 		 4342 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  34.95 
 
 		 1474 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  36.36 
 
 		 3231 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  34.25 
 
 		 4317 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 608 aa  283  6.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  34.19 
 
 		 4317 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  34.25 
 
 		 4317 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 597 aa  283  9e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 597 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  33.96 
 
 		 4336 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 599 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  34.68 
 
 		 4342 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  34.29 
 
 		 755 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  36.08 
 
 		 4318 aa  280  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  32.85 
 
 		 581 aa  279  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  35.16 
 
 		 6274 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.94 
 
 		 6889 aa  277  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.59 
 
 		 4336 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  35.16 
 
 		 6272 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  35.16 
 
 		 6271 aa  276  7e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 602 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  32.12 
 
 		 581 aa  275  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.53 
 
 		 6403 aa  270  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  35.58 
 
 		 1776 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  35.16 
 
 		 4165 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1806  polyketide synthase protein  35.68 
 
 		 4268 aa  264  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0723509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  34.79 
 
 		 1789 aa  264  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 		 1272 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 701 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  32.73 
 
 		 1753 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  36.9 
 
 		 3208 aa  261  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41238  predicted protein  33.16 
 
 		 738 aa  259  7e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  33.39 
 
 		 1323 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>