More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0402 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  56.45 
 
 		 583 aa  650    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12955  acyl-CoA synthetase  57.49 
 
 		 580 aa  660    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  55.83 
 
 		 584 aa  636    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  72.6 
 
 		 590 aa  840    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  72.43 
 
 		 590 aa  838    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 573 aa  1166    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  72.43 
 
 		 590 aa  838    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  58.29 
 
 		 578 aa  670    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  74.78 
 
 		 573 aa  855    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13860  acyl-CoA synthetase  56.45 
 
 		 584 aa  633  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3129  acyl-CoA synthetase  54.81 
 
 		 592 aa  623  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.853236  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  54.45 
 
 		 601 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  54.45 
 
 		 601 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  54.64 
 
 		 592 aa  618  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  54.45 
 
 		 601 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  52.51 
 
 		 626 aa  595  1e-169  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  52.41 
 
 		 619 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  51.39 
 
 		 576 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3394  acyl-CoA synthetase  52.26 
 
 		 577 aa  566  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.682932  normal  0.36093 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2867  acyl-CoA synthetase  51.56 
 
 		 580 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.70026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2836  acyl-CoA synthetase  51.56 
 
 		 580 aa  567  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.562117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2880  acyl-CoA synthetase  51.56 
 
 		 631 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.894395  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10409  acyl-CoA synthetase  42.47 
 
 		 585 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  42.41 
 
 		 597 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  42.93 
 
 		 574 aa  399  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.86 
 
 		 1656 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  36.89 
 
 		 2997 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  37.7 
 
 		 1067 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.46 
 
 		 629 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3604  putative fatty-acid--CoA ligase  40.94 
 
 		 593 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.698537  normal  0.297666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.25 
 
 		 629 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  38.88 
 
 		 599 aa  350  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13835  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.63 
 
 		 637 aa  349  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.331415  normal  0.284181 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 611 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5011  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.53 
 
 		 629 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.934148  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5099  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.53 
 
 		 629 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5392  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.53 
 
 		 629 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.117566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0174  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 636 aa  342  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 602 aa  341  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.51 
 
 		 2762 aa  339  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 		 579 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 725 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 725 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 640 aa  334  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 		 597 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 597 aa  330  6e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11954  putative fatty-acid--CoA ligase  36.97 
 
 		 620 aa  329  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.607108 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  34.91 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 614 aa  328  2.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 		 578 aa  327  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.52 
 
 		 4332 aa  326  6e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  36.62 
 
 		 4342 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  35.85 
 
 		 4317 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 991 aa  325  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  35.85 
 
 		 4317 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.15 
 
 		 4342 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.03 
 
 		 4317 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  38.07 
 
 		 4318 aa  323  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  34.15 
 
 		 581 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  37.83 
 
 		 2791 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  36.81 
 
 		 1801 aa  322  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 586 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3869  putative fatty-acid--CoA ligase  37.83 
 
 		 605 aa  320  7e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3943  putative fatty-acid--CoA ligase  37.83 
 
 		 605 aa  320  7e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.082676  normal  0.0172927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 592 aa  319  7.999999999999999e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  35.75 
 
 		 4317 aa  319  9e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 582 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  34.31 
 
 		 588 aa  319  1e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2901  putative fatty-acid--CoA ligase  38.75 
 
 		 593 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650918  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3855  putative fatty-acid--CoA ligase  38 
 
 		 605 aa  318  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724696  hitchhiker  0.00746256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  37.56 
 
 		 2103 aa  317  4e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  36.33 
 
 		 1474 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 596 aa  315  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  36.61 
 
 		 3235 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  35.92 
 
 		 4336 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  35.39 
 
 		 4336 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2966  putative fatty-acid--CoA ligase  36.71 
 
 		 607 aa  310  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.453521  normal  0.382652 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  37.98 
 
 		 1699 aa  309  9e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  36.67 
 
 		 6403 aa  307  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 		 706 aa  306  7e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 608 aa  304  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  37.35 
 
 		 2250 aa  302  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 595 aa  299  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  34.83 
 
 		 620 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  36.59 
 
 		 609 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  35.71 
 
 		 617 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  35.71 
 
 		 617 aa  294  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.97 
 
 		 6889 aa  293  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  35.51 
 
 		 617 aa  292  9e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  35.09 
 
 		 1776 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 593 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  35.38 
 
 		 3231 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  35.66 
 
 		 610 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  35.89 
 
 		 1981 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  35.66 
 
 		 610 aa  290  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  35.66 
 
 		 599 aa  289  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  35.66 
 
 		 599 aa  289  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  35.66 
 
 		 610 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  35.66 
 
 		 599 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 1272 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>