More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3404 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 551 aa  1137    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.36 
 
 		 1656 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 614 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 		 725 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 		 725 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  40 
 
 		 2820 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  36.46 
 
 		 588 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 611 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  39.54 
 
 		 2791 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  39.15 
 
 		 579 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  36.85 
 
 		 609 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  37.83 
 
 		 2997 aa  362  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  37.81 
 
 		 1801 aa  359  6e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  36.65 
 
 		 2762 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 586 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 602 aa  346  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  37.17 
 
 		 1067 aa  342  8e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  35.58 
 
 		 596 aa  340  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 599 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.21 
 
 		 4342 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  37.94 
 
 		 4332 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 597 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 597 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  37.68 
 
 		 4342 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  35.01 
 
 		 1474 aa  334  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  37.54 
 
 		 2103 aa  332  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  36.1 
 
 		 592 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  37.48 
 
 		 1789 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  37.7 
 
 		 4318 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  40.64 
 
 		 3208 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  37.12 
 
 		 4317 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 		 706 aa  326  6e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  37.14 
 
 		 4336 aa  326  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 610 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  37.73 
 
 		 3231 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  36.94 
 
 		 4317 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 610 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 593 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 610 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 599 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 599 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  35.87 
 
 		 599 aa  323  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  37.92 
 
 		 755 aa  323  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  36.82 
 
 		 2250 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 991 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  36.87 
 
 		 4317 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  36.48 
 
 		 1779 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.98 
 
 		 4336 aa  320  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  35.84 
 
 		 6403 aa  316  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  34.17 
 
 		 2721 aa  316  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  36.94 
 
 		 3235 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  36.51 
 
 		 4317 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  37.15 
 
 		 6274 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6079  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 		 555 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  hitchhiker  0.00908459 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  37.15 
 
 		 6271 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  37.15 
 
 		 6272 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  34.77 
 
 		 559 aa  309  8e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  34.77 
 
 		 564 aa  309  8e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  35.1 
 
 		 622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 608 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  34.62 
 
 		 1283 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  34.62 
 
 		 1291 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 1323 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 595 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1849  AMP-binding domain-containing protein  36.2 
 
 		 621 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0427  AMP-binding enzyme  36.2 
 
 		 621 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  34.69 
 
 		 1276 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  34.66 
 
 		 581 aa  302  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0523  AMP-binding enzyme  36.2 
 
 		 621 aa  302  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.746199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3124  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 601 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  34.89 
 
 		 581 aa  300  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  33.76 
 
 		 559 aa  300  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  35.92 
 
 		 1776 aa  299  9e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  33.68 
 
 		 578 aa  298  2e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  34.95 
 
 		 1699 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 582 aa  298  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  33.1 
 
 		 601 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  33.1 
 
 		 601 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2154  AMP-binding domain-containing protein  35.68 
 
 		 621 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1459  AMP-binding domain-containing protein  35.68 
 
 		 621 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0838  AMP-binding domain-containing protein  35.68 
 
 		 621 aa  297  3e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  33.04 
 
 		 576 aa  297  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  31.7 
 
 		 620 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  32.2 
 
 		 617 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  34.84 
 
 		 606 aa  296  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  32.03 
 
 		 617 aa  296  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  32.03 
 
 		 617 aa  296  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.74 
 
 		 6889 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  32.58 
 
 		 619 aa  295  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 701 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 684 aa  286  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.839841  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 1272 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  32.93 
 
 		 583 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  35.47 
 
 		 1981 aa  281  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  32.92 
 
 		 4165 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  32.52 
 
 		 584 aa  281  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  32.24 
 
 		 590 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  32.22 
 
 		 1753 aa  279  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0402  acyl-CoA synthetase  32.74 
 
 		 573 aa  279  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795318  normal  0.658379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>