More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2748 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2748  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 600 aa  1219    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 561 aa  298  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3738  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 		 519 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 949 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  34.34 
 
 		 1474 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 		 958 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  30.34 
 
 		 936 aa  231  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  31.81 
 
 		 962 aa  231  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 942 aa  231  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  30.17 
 
 		 852 aa  228  2e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  33.22 
 
 		 4336 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  34.56 
 
 		 4318 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  31.02 
 
 		 1035 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 578 aa  217  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  33.47 
 
 		 3208 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 958 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.43 
 
 		 544 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33.27 
 
 		 4317 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  32.32 
 
 		 606 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.92 
 
 		 4336 aa  212  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  29.17 
 
 		 2997 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  33.75 
 
 		 4317 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.04 
 
 		 4317 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 592 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  33.57 
 
 		 4317 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 947 aa  209  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 706 aa  209  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  31.7 
 
 		 2791 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  35.87 
 
 		 1779 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  32.16 
 
 		 4332 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 586 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.48 
 
 		 544 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 544 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.29 
 
 		 4342 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 544 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.94 
 
 		 4342 aa  204  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 544 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 1272 aa  203  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  30.3 
 
 		 588 aa  203  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 586 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0181  peptide synthetase NRPS5-4-3  31.58 
 
 		 1005 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11562  acyl-CoA synthetase  32.43 
 
 		 584 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1588  AMP-binding domain-containing protein  31.59 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  32.07 
 
 		 1067 aa  201  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 701 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4860  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 		 582 aa  201  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  31.41 
 
 		 1656 aa  200  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 		 586 aa  200  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  28.57 
 
 		 581 aa  197  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  28.52 
 
 		 581 aa  197  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  31.45 
 
 		 1291 aa  197  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  31.45 
 
 		 1283 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 		 614 aa  196  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  31.42 
 
 		 605 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  31.45 
 
 		 1276 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.42 
 
 		 2762 aa  196  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.73 
 
 		 560 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4760  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 597 aa  195  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  31.34 
 
 		 6889 aa  194  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 596 aa  194  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  30.93 
 
 		 1699 aa  194  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.06 
 
 		 544 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.06 
 
 		 544 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  30.95 
 
 		 1323 aa  193  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  27.57 
 
 		 3099 aa  193  9e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  28.91 
 
 		 602 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0389  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 586 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0821  acyl-CoA synthetase  30.31 
 
 		 585 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  30.07 
 
 		 577 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 579 aa  191  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.04 
 
 		 544 aa  191  4e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  29.82 
 
 		 1801 aa  191  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  32.14 
 
 		 6403 aa  190  8e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3404  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 551 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.469336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.81 
 
 		 546 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  31.69 
 
 		 3235 aa  189  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3109  aspartate racemase  32.92 
 
 		 1981 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 534 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.586249 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 595 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3072  AMP-dependent synthetase and ligase  28.51 
 
 		 684 aa  189  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.839841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  30.58 
 
 		 574 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 725 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 1292 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 725 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0214  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 		 640 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.541656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  29.26 
 
 		 3231 aa  188  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3155  acyl-CoA synthetase  29.46 
 
 		 576 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3442  acyl-CoA synthetase  29.26 
 
 		 576 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02851  putative saframycin Mx1 synthetase B  29.29 
 
 		 576 aa  187  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000692091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0718  acyl-CoA synthetase  29.26 
 
 		 573 aa  187  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02801  hypothetical protein  29.29 
 
 		 573 aa  187  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000478815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  29.48 
 
 		 611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3965  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 		 613 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666614  normal  0.454806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.92 
 
 		 544 aa  185  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 		 653 aa  185  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3260  acyl-CoA synthetase  28.74 
 
 		 563 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1011  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 		 1976 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  32.18 
 
 		 590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  32.18 
 
 		 590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>