More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1011 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 1419 aa  652    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.169022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1011  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 1976 aa  3826    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2414  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 1818 aa  632  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  29.77 
 
 		 2681 aa  619  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  27.85 
 
 		 3374 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  31.85 
 
 		 3099 aa  306  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  31.43 
 
 		 3235 aa  306  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03122  putative peptide synthase protein  35.27 
 
 		 937 aa  301  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0204  peptide synthetase, putative  35.74 
 
 		 983 aa  295  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1644  putative peptide synthase protein  35.68 
 
 		 1013 aa  293  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0178  putative non-ribosomal peptide synthase  35.68 
 
 		 1052 aa  292  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0269  putative non-ribosomal peptide synthase  35.68 
 
 		 935 aa  291  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.977076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  30.84 
 
 		 3718 aa  291  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  30.24 
 
 		 2753 aa  272  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 		 653 aa  264  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  30.04 
 
 		 7122 aa  262  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 		 949 aa  239  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 958 aa  236  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 958 aa  229  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  30.15 
 
 		 4186 aa  216  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 962 aa  211  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  26.9 
 
 		 4101 aa  205  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0652  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.17 
 
 		 546 aa  205  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 577 aa  204  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03396  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  29.86 
 
 		 938 aa  202  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.111704 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 600 aa  202  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 600 aa  202  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 600 aa  201  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  31.15 
 
 		 1035 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32420  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.27 
 
 		 560 aa  199  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.300153  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 942 aa  196  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 947 aa  196  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4552  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.03 
 
 		 563 aa  194  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  28.17 
 
 		 594 aa  193  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2748  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 600 aa  193  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  33.41 
 
 		 1336 aa  193  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 587 aa  192  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.68 
 
 		 544 aa  191  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0614831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.68 
 
 		 544 aa  191  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.893245  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3166  AMP-binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 588 aa  188  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2880  AMP-binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 577 aa  188  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0136  AMP-binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 577 aa  188  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1452  AMP-binding domain-containing protein  30.21 
 
 		 577 aa  188  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  33.09 
 
 		 888 aa  188  9e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 580 aa  187  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0198968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1051  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.82 
 
 		 544 aa  187  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0549  AMP-binding domain-containing protein  30.04 
 
 		 588 aa  187  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0531  AMP-binding domain-containing protein  29.67 
 
 		 635 aa  187  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.612015  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  27.15 
 
 		 852 aa  184  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.34 
 
 		 544 aa  184  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.705391  normal  0.256075 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1935  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.29 
 
 		 544 aa  184  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0140383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5237  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.34 
 
 		 544 aa  184  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0398716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0718  AMP-binding domain-containing protein  29.75 
 
 		 686 aa  183  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0642699  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5217  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.41 
 
 		 544 aa  183  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  30.51 
 
 		 2867 aa  182  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  31.62 
 
 		 3235 aa  182  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5617  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.36 
 
 		 544 aa  183  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  27.15 
 
 		 936 aa  182  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  42.56 
 
 		 1363 aa  181  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4798  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.29 
 
 		 544 aa  181  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  30.89 
 
 		 4336 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  31.25 
 
 		 1334 aa  177  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  31.14 
 
 		 599 aa  177  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 706 aa  177  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  31.84 
 
 		 1789 aa  177  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  31.09 
 
 		 610 aa  176  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4912  amino acid adenylation domain protein  31.32 
 
 		 1715 aa  176  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.650159  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 544 aa  176  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4640  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.74 
 
 		 544 aa  175  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  31.09 
 
 		 599 aa  175  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  29.5 
 
 		 2721 aa  175  6.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  31.09 
 
 		 599 aa  175  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  30.97 
 
 		 610 aa  174  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  31.09 
 
 		 610 aa  174  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08513  TdiA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A7XRY0]  28.64 
 
 		 949 aa  174  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0283406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.14 
 
 		 4332 aa  174  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  31.85 
 
 		 4342 aa  174  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1688  acyl-CoA synthetase  30.09 
 
 		 568 aa  173  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  28.92 
 
 		 574 aa  173  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  29.62 
 
 		 1699 aa  172  6e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1929  AMP-dependent synthetase and ligase  28.64 
 
 		 648 aa  172  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  30.63 
 
 		 1776 aa  172  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  30.35 
 
 		 3498 aa  171  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  28.42 
 
 		 1753 aa  170  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 839 aa  170  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  28.27 
 
 		 1331 aa  170  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.42 
 
 		 4342 aa  170  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.95 
 
 		 562 aa  169  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 586 aa  169  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  27.34 
 
 		 1801 aa  168  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3074  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 603 aa  167  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0248989  normal  0.398199 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 586 aa  168  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  26.96 
 
 		 584 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 592 aa  167  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  28.34 
 
 		 588 aa  167  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0417  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 		 586 aa  166  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.393755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  29.43 
 
 		 4317 aa  166  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  33.66 
 
 		 1436 aa  166  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  29.29 
 
 		 4317 aa  166  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  29.72 
 
 		 1779 aa  165  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>