More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03122 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03122  putative peptide synthase protein  100 
 
 		 937 aa  1912    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1644  putative peptide synthase protein  62.28 
 
 		 1013 aa  1133    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0178  putative non-ribosomal peptide synthase  62.39 
 
 		 1052 aa  1145    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0204  peptide synthetase, putative  61.37 
 
 		 983 aa  1151    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0269  putative non-ribosomal peptide synthase  62.39 
 
 		 935 aa  1147    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.977076  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03396  NRPS-like enzyme, putative (JCVI)  37.51 
 
 		 938 aa  540  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.111704 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08513  TdiA [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A7XRY0]  34.59 
 
 		 949 aa  452  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0283406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 1419 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.169022 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  33.22 
 
 		 2681 aa  346  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2414  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 1818 aa  305  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1011  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 1976 aa  292  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  32.69 
 
 		 3374 aa  291  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  26.64 
 
 		 3235 aa  262  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  27 
 
 		 991 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  26.94 
 
 		 3099 aa  231  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  27.06 
 
 		 3718 aa  221  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 958 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  26.81 
 
 		 4101 aa  218  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  27.66 
 
 		 7122 aa  214  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3073  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 653 aa  214  9e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168838  normal  0.191593 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  26.8 
 
 		 1336 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  25.19 
 
 		 888 aa  202  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  26.57 
 
 		 2352 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2145  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 958 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  27.15 
 
 		 1334 aa  199  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 949 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2129  acyltransferase family protein  27.96 
 
 		 852 aa  195  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0194  acyl-CoA synthetase  28.15 
 
 		 936 aa  195  4e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5195  amino acid adenylation domain protein  24.27 
 
 		 2753 aa  194  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.628302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  27 
 
 		 6676 aa  193  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  28.32 
 
 		 3235 aa  193  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  27.63 
 
 		 4317 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1439 aa  189  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  25.4 
 
 		 2385 aa  187  8e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  29 
 
 		 1067 aa  187  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7411  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 587 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  28.81 
 
 		 4318 aa  186  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  29.57 
 
 		 947 aa  186  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0626569  normal  0.797277 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  24.95 
 
 		 1336 aa  185  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2559  acyl-CoA synthetase  27.43 
 
 		 574 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  26.69 
 
 		 2855 aa  185  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  27.06 
 
 		 1753 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  25.15 
 
 		 2385 aa  184  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.15 
 
 		 2385 aa  184  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  26.83 
 
 		 1801 aa  183  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5637  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 		 600 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6002  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 		 600 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  28.95 
 
 		 1699 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  24.55 
 
 		 4968 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3393  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 942 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0997952  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6493  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 600 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.679743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  27.61 
 
 		 4317 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  27.19 
 
 		 4317 aa  181  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  28.1 
 
 		 4332 aa  180  9e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.8 
 
 		 2385 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.8 
 
 		 2385 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.06 
 
 		 2385 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  24.58 
 
 		 2386 aa  179  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  26.13 
 
 		 2877 aa  179  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18360  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.25 
 
 		 577 aa  179  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0943  AMP-binding domain-containing protein  27.91 
 
 		 1035 aa  179  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  25.46 
 
 		 1331 aa  178  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  24.78 
 
 		 3291 aa  177  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 		 577 aa  177  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  26.7 
 
 		 4336 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  26.43 
 
 		 2846 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  24.97 
 
 		 2386 aa  177  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  25.34 
 
 		 2385 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  27.5 
 
 		 4317 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  27.75 
 
 		 1779 aa  176  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7006  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 		 962 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.96639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2295  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 		 839 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  24.63 
 
 		 2385 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  25.63 
 
 		 6661 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  26.24 
 
 		 4531 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  27.09 
 
 		 4342 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  27.63 
 
 		 3208 aa  171  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  24.75 
 
 		 2385 aa  170  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  25.16 
 
 		 1317 aa  169  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  25.88 
 
 		 1789 aa  169  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  25.26 
 
 		 2762 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  27.53 
 
 		 2250 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  26.13 
 
 		 4336 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2748  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 		 600 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2770  AMP-dependent synthetase and ligase  27.14 
 
 		 584 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  26.82 
 
 		 1363 aa  168  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  27.3 
 
 		 3328 aa  168  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6150  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 		 594 aa  168  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102681  normal  0.566386 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0418  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 		 586 aa  168  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  27.3 
 
 		 3352 aa  168  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  26.13 
 
 		 13537 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  23.27 
 
 		 4960 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  27.26 
 
 		 6072 aa  167  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  27.26 
 
 		 6081 aa  167  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  27.3 
 
 		 6006 aa  167  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4183  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 		 586 aa  167  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  23.73 
 
 		 4960 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3427  enterobactin synthase subunit F  26.74 
 
 		 1325 aa  166  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.168919  normal  0.066928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 579 aa  166  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  27.59 
 
 		 1383 aa  165  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>