186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0447 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0447  Peptidase M23  100 
 
 
442 aa  863    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.491927 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1423  Peptidase M23  54.62 
 
 
461 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1482  peptidase M23B  38.05 
 
 
522 aa  83.2  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.151999  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  24.54 
 
 
436 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  22.84 
 
 
465 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  23.51 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  23.76 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  23.8 
 
 
379 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  21.87 
 
 
397 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  22.57 
 
 
503 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  25.24 
 
 
372 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  25.82 
 
 
477 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  22.15 
 
 
495 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  26.6 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  22.33 
 
 
412 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  22.14 
 
 
420 aa  57.8  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  27.69 
 
 
432 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  26.44 
 
 
448 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  22.87 
 
 
374 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  33.33 
 
 
697 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  33.33 
 
 
697 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02615  peptidase, M23/M37 family protein  36.59 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  32.38 
 
 
699 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  30.77 
 
 
455 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  23.26 
 
 
374 aa  55.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  33.06 
 
 
442 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  27.43 
 
 
469 aa  54.7  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  27.48 
 
 
681 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  21.45 
 
 
424 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  32.71 
 
 
287 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  27.48 
 
 
676 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  26.57 
 
 
419 aa  53.5  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  27.78 
 
 
441 aa  53.1  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  33.01 
 
 
353 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  33.98 
 
 
436 aa  52.4  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  27.27 
 
 
419 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  29.77 
 
 
646 aa  52.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  25.73 
 
 
445 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  30.83 
 
 
651 aa  51.6  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  32.95 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  20.83 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  31.36 
 
 
464 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  31.43 
 
 
665 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  38.2 
 
 
446 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  30.83 
 
 
651 aa  51.6  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  34.86 
 
 
676 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  29.82 
 
 
482 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  28.26 
 
 
225 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  29.27 
 
 
516 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  30.53 
 
 
621 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  33.33 
 
 
695 aa  51.2  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  34.21 
 
 
439 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  19.06 
 
 
441 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  31.91 
 
 
299 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  30 
 
 
651 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  32.04 
 
 
429 aa  51.2  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  34.21 
 
 
470 aa  50.8  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  34.34 
 
 
539 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  28.89 
 
 
498 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  23.43 
 
 
377 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  22.7 
 
 
417 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  22.7 
 
 
417 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  28.97 
 
 
375 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  23.92 
 
 
423 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  28.57 
 
 
231 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  26.38 
 
 
387 aa  50.1  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  31.73 
 
 
569 aa  50.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  29.77 
 
 
343 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  23.84 
 
 
440 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  23.68 
 
 
423 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  33.33 
 
 
475 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  33.03 
 
 
680 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  27.5 
 
 
645 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  29.52 
 
 
674 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  20.54 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  27.27 
 
 
656 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  29.77 
 
 
615 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  32.21 
 
 
447 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  32.11 
 
 
681 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02890  putative peptidase  31.46 
 
 
320 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.648813  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  24.14 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  32.21 
 
 
447 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  33.33 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  44.26 
 
 
433 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  42.86 
 
 
466 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  28.79 
 
 
581 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  28.85 
 
 
533 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  33.03 
 
 
695 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  28.46 
 
 
446 aa  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  28.1 
 
 
417 aa  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  34.21 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  33.94 
 
 
360 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  33.94 
 
 
360 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  33.94 
 
 
360 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  20.91 
 
 
396 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000457  peptidase M23  34.25 
 
 
325 aa  47.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  26.87 
 
 
440 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  22.46 
 
 
402 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  26.87 
 
 
440 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  34.21 
 
 
468 aa  47.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>