66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1482 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1482  peptidase M23B  100 
 
 
522 aa  992    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.151999  normal  0.918373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1423  Peptidase M23  31.13 
 
 
461 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0447  Peptidase M23  37.7 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.491927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  31.28 
 
 
455 aa  66.6  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  25.11 
 
 
503 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  30.13 
 
 
420 aa  61.6  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  29.5 
 
 
377 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  28.83 
 
 
375 aa  57.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  27.02 
 
 
456 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  27.02 
 
 
456 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  27.02 
 
 
456 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  24.02 
 
 
377 aa  57  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  25.53 
 
 
412 aa  56.6  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  34.51 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  35.83 
 
 
445 aa  54.3  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  28.7 
 
 
379 aa  54.3  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  23.75 
 
 
432 aa  53.5  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  22.4 
 
 
432 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  21.12 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  28.91 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  25.85 
 
 
402 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  21.57 
 
 
399 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  24.86 
 
 
481 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  34.07 
 
 
404 aa  52.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  21.01 
 
 
399 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  27.87 
 
 
469 aa  51.2  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  21.88 
 
 
436 aa  50.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  25.36 
 
 
376 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  29.12 
 
 
378 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  23.65 
 
 
503 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  27.13 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  24.35 
 
 
397 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  29.75 
 
 
387 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  30.97 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  27.91 
 
 
411 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1270  peptidase M23B  28.57 
 
 
419 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  34.86 
 
 
475 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02890  putative peptidase  28.57 
 
 
320 aa  48.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.648813  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  30.89 
 
 
314 aa  48.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  27.36 
 
 
475 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  25.86 
 
 
433 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  29.69 
 
 
446 aa  47.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  25.85 
 
 
405 aa  47  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  28.69 
 
 
419 aa  47  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  28.69 
 
 
419 aa  47  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  28.69 
 
 
419 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  28.69 
 
 
419 aa  47  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  28.24 
 
 
375 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  28.69 
 
 
427 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  28.69 
 
 
419 aa  47  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  28.69 
 
 
427 aa  47  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  38.24 
 
 
339 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  28.69 
 
 
427 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  28.69 
 
 
427 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  23.86 
 
 
424 aa  45.8  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  26.74 
 
 
466 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  26.5 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  29.63 
 
 
477 aa  45.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0201  signal recognition particle-docking protein FtsY  46.26 
 
 
491 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00197589  decreased coverage  0.000000348094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  26.74 
 
 
466 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  23.7 
 
 
379 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  25.24 
 
 
374 aa  44.3  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  31.58 
 
 
392 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  22.6 
 
 
516 aa  44.3  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  31.2 
 
 
313 aa  44.3  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  28.09 
 
 
363 aa  43.5  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>