More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0522 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  100 
 
 		 516 aa  1036    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  61.12 
 
 		 495 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  58.08 
 
 		 503 aa  553  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  52.46 
 
 		 503 aa  486  1e-136  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  40.99 
 
 		 436 aa  359  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  42.51 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  41.6 
 
 		 400 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  27.31 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  37.29 
 
 		 412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  26.62 
 
 		 418 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  38.13 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  29.39 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  30 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  32.93 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  33.73 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  29.09 
 
 		 455 aa  90.1  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  29.53 
 
 		 422 aa  87  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  32.61 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  40.6 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  39.1 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  27.9 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  30.07 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  38.46 
 
 		 453 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  40.6 
 
 		 471 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  36.36 
 
 		 500 aa  82.4  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  23.18 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  34.81 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  33.86 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  39.69 
 
 		 474 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  39.1 
 
 		 464 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  34.87 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  35.53 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  35.53 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  34.65 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  25.77 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  32.45 
 
 		 530 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  25.2 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  35.53 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  33.17 
 
 		 534 aa  80.9  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  25 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  25 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  31.78 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  34.65 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  35.29 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  34.65 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  39.23 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  37.9 
 
 		 319 aa  79.7  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  37.04 
 
 		 382 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  29.71 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  35.46 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  34.56 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  34.56 
 
 		 377 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  37.04 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  23.33 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  35.04 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2540  peptidase M23B  37.04 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.258183  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  37.9 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  33.33 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 303 aa  76.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  33.33 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  33.33 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  33.33 
 
 		 362 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  29.96 
 
 		 366 aa  76.6  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  33.58 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  29.1 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  32.84 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  34.59 
 
 		 388 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  34.59 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  35.33 
 
 		 538 aa  73.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  31.34 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  31.78 
 
 		 436 aa  73.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  31.65 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  29.01 
 
 		 352 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  37.3 
 
 		 251 aa  72.8  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  32.09 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  31.85 
 
 		 377 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  31.82 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  35.16 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  34.43 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  25.72 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  31.17 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  35.09 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  30.43 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2869  Peptidase M23  36.43 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  27.81 
 
 		 394 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.47 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  33.59 
 
 		 381 aa  70.1  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  30.87 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  30.43 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  35 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  34.43 
 
 		 318 aa  69.3  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  35.86 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  36.92 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  34.21 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  33.85 
 
 		 582 aa  67.8  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  32.68 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  29.05 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  27.67 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  35.2 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>