More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0562 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  100 
 
 
465 aa  943    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  48.98 
 
 
503 aa  450  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  49.7 
 
 
495 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  51.27 
 
 
516 aa  436  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  47.52 
 
 
503 aa  428  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  45.11 
 
 
436 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  46.06 
 
 
400 aa  342  5.999999999999999e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  29.95 
 
 
418 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  27.36 
 
 
394 aa  140  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  27.75 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  25 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  24.31 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  25.4 
 
 
431 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  23.77 
 
 
422 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  23.14 
 
 
417 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  38.19 
 
 
490 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  23.42 
 
 
419 aa  100  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  24.25 
 
 
446 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  24.39 
 
 
407 aa  97.1  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  24.57 
 
 
456 aa  96.7  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  29.24 
 
 
430 aa  96.7  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  24.35 
 
 
456 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  24.35 
 
 
456 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  24.57 
 
 
416 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  27.17 
 
 
420 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  22.91 
 
 
433 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  33.77 
 
 
370 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  24.59 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  24.15 
 
 
388 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  22.44 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  23.88 
 
 
428 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  34.23 
 
 
372 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  24.58 
 
 
404 aa  87  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  25.47 
 
 
394 aa  87  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  31.05 
 
 
373 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  25.24 
 
 
391 aa  86.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  31.05 
 
 
372 aa  86.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  32.74 
 
 
500 aa  85.9  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  27.86 
 
 
428 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  24.53 
 
 
366 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  39.1 
 
 
449 aa  84.3  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  24.88 
 
 
441 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  23.06 
 
 
434 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  39.01 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  22.44 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  39.85 
 
 
478 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  23.38 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  39.52 
 
 
484 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  38.93 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  38.35 
 
 
464 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  24.44 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  20.64 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  22.94 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  38.35 
 
 
471 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  41.24 
 
 
352 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2540  peptidase M23B  37.96 
 
 
304 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.258183  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  22.58 
 
 
424 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  37.1 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  37.1 
 
 
369 aa  77.4  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.08 
 
 
303 aa  77  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  22.48 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  28.05 
 
 
405 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  35.77 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  26.95 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  24.33 
 
 
314 aa  75.5  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  24.59 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.71 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  30.82 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  30.82 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  32.08 
 
 
438 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  25.31 
 
 
375 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  23.06 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1402  peptidase M23B  38.94 
 
 
204 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  24.83 
 
 
438 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  30.14 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  32.77 
 
 
477 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  30.82 
 
 
362 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  30.82 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  30.82 
 
 
362 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  26.73 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  34.15 
 
 
247 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1572  peptidase, M23/M37 family  36.28 
 
 
204 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.42945e-48 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  30.82 
 
 
362 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  30.82 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1362  cell wall endopeptidase  36.28 
 
 
204 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.83171e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1361  cell wall endopeptidase  36.28 
 
 
204 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000286273  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1640  peptidase, M23/M37 family  36.28 
 
 
204 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000676143  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  22.76 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  25.97 
 
 
455 aa  71.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  30.83 
 
 
432 aa  71.2  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2912  peptidase M23B  33.87 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  22.81 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  37.01 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  32.84 
 
 
458 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  34.4 
 
 
318 aa  70.5  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  22.44 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  35.48 
 
 
649 aa  70.5  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1604  M24/M37 family peptidase  36.28 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000454274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  36.36 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  21.86 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>