More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0282 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0282  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
390 aa  738    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0141  glycosyl transferase group 1  85.71 
 
 
394 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339418  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0198  glycosyl transferase group 1  84.94 
 
 
394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.458254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  29.4 
 
 
748 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  34.01 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  29.95 
 
 
424 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  33.81 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1223  glycosyl transferase group 1  38.21 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.764713  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.86 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  31.54 
 
 
447 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0299  glycosyl transferase, group 1  20.92 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3400  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.86 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326761 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  33.47 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.85 
 
 
410 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  22.87 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  29.56 
 
 
458 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  37.44 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4917  group 1 glycosyl transferase  29.58 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 
411 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.41 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.41 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.41 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  26.41 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  31.81 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 
412 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  33.83 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1065  glycosyl transferase, group 1  25.75 
 
 
414 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  23.41 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  35.82 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  23.41 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6402  glycosyl transferase group 1  32.68 
 
 
517 aa  64.3  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
382 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
800 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2609  UDP-N-acetylglucosamine  29.87 
 
 
420 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00070619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  28.27 
 
 
421 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  28.86 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.23 
 
 
391 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  41.12 
 
 
355 aa  63.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.07 
 
 
376 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
421 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  23.89 
 
 
417 aa  63.2  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
371 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 
410 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  36.31 
 
 
364 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2470  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
345 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0397  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  27.76 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  28.21 
 
 
420 aa  62  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.61 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  30.35 
 
 
450 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  29.66 
 
 
427 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  20.9 
 
 
390 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  21.68 
 
 
379 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 
404 aa  60.8  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2314  glycosyl transferase group 1  36.94 
 
 
347 aa  60.8  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.055827  normal  0.292913 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 
419 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  38.86 
 
 
379 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  28.57 
 
 
414 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  35.65 
 
 
360 aa  60.1  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
391 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
710 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  31.61 
 
 
358 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 
346 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.52 
 
 
388 aa  59.7  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  25 
 
 
393 aa  59.7  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
375 aa  59.7  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
426 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
381 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.55 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  44.14 
 
 
408 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  33.91 
 
 
405 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1176  glycosyl transferase, group 1  35.09 
 
 
349 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  21.23 
 
 
402 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  39.55 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  39.55 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  35.2 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0879  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
393 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.418877  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.41 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5888  glycosyl transferase group 1  31.84 
 
 
389 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355509  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  26.4 
 
 
415 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  44.09 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  33.15 
 
 
398 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>