More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0141 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0141  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
394 aa  748    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.339418  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0198  glycosyl transferase group 1  95.43 
 
 
394 aa  637    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.458254 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0282  glycosyl transferase group 1  85.75 
 
 
390 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416078  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1184  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 
748 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.7 
 
 
395 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  30.13 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.95 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3592  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.157633  hitchhiker  0.00114643 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  29.1 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  27.52 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.75 
 
 
392 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.37 
 
 
382 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  30.84 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
416 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  29.72 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  28.78 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.79 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  30.37 
 
 
768 aa  70.1  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  42.99 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6402  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
517 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.195294 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0240  glucosyltransferase  23.92 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  22.54 
 
 
410 aa  66.6  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  22.86 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  29.98 
 
 
458 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5074  UDP-N-acetylglucosamine  30.88 
 
 
418 aa  64.7  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838773  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4917  group 1 glycosyl transferase  26.84 
 
 
422 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  27.1 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 
435 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2483  glycosyl transferase group 1  27.34 
 
 
414 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.391566  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2261  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
430 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
377 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  34.59 
 
 
360 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.4 
 
 
382 aa  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  36.36 
 
 
388 aa  63.2  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0294  hypothetical protein  22.85 
 
 
395 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2407  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.42 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0928502 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
435 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  21.2 
 
 
390 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1086  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0607003  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 
377 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4278  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  41.44 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54539  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.8 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1223  glycosyl transferase group 1  35.47 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.764713  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4147  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  40.1 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2341  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 
345 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.64 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4300  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  41.44 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  22.64 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.92 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0720  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.450212 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  22.68 
 
 
398 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
376 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  29.46 
 
 
377 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5481  Glycosyltransferase-like protein  27.11 
 
 
933 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.401117  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3641  hypothetical protein  22.57 
 
 
384 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.802577  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1784  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 
379 aa  60.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2072  group 1 glycosyl transferase  34.62 
 
 
375 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
371 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
415 aa  60.1  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  32.98 
 
 
304 aa  60.1  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  23.17 
 
 
391 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1432  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.65 
 
 
427 aa  59.7  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.285066  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1978  glycogen synthase  26.35 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.215698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  38.5 
 
 
381 aa  59.7  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
346 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  20.98 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  32.98 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  35.2 
 
 
394 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  23.24 
 
 
391 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3300  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00341584  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1310  glycosyl transferase group 1  26.95 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
412 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06140  glycosyltransferase  36.67 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.988146 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0763  glycosyl transferase, group 1  34.34 
 
 
337 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3877  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 
432 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  31.42 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2562  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.97 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  23.7 
 
 
387 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  36.94 
 
 
405 aa  58.2  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  29.21 
 
 
377 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  35.91 
 
 
775 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>