66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2699 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2699  PAS fold-4 domain protein  100 
 
 		 248 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4708  putative PAS/PAC sensor protein  57.78 
 
 		 243 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0753  putative PAS/PAC sensor protein  60.62 
 
 		 237 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0509  hypothetical protein  62.22 
 
 		 169 aa  178  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.838827  normal  0.0478661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0472  hypothetical protein  58.52 
 
 		 169 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.544597  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0438  hypothetical protein  58.52 
 
 		 169 aa  169  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.684264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0110  hypothetical protein  58.73 
 
 		 155 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4797  hypothetical protein  57.94 
 
 		 155 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0235215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0096  hypothetical protein  58.91 
 
 		 166 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0492  hypothetical protein  58.91 
 
 		 166 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  58.12 
 
 		 602 aa  151  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 		 725 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  51.67 
 
 		 907 aa  125  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  40.35 
 
 		 744 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 		 1261 aa  68.9  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.36 
 
 		 1559 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1587  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.43 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.275085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 1171 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0589  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.97 
 
 		 305 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3196  Fis family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 494 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  39 
 
 		 1092 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 977 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0936  GGDEF domain-containing protein  24.86 
 
 		 301 aa  52.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38 
 
 		 1103 aa  52  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 871 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1960  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.09 
 
 		 318 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1163  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.1 
 
 		 325 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.538197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0867  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.16 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.711393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.03 
 
 		 1419 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0117  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  30.97 
 
 		 845 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.734428  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1976  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.43 
 
 		 461 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1086 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2540  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 809 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.68 
 
 		 1052 aa  46.6  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.697707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1337  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 		 126 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 698 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 1171 aa  45.4  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2969  sensory box/GGDEF family protein  23.01 
 
 		 315 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  27.72 
 
 		 1086 aa  45.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 		 2654 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3480  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00742863  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 		 1092 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 821 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.97 
 
 		 900 aa  43.9  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1350  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.31 
 
 		 715 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1380  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.31 
 
 		 715 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.923401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1371  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 		 516 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 912 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1684  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  25.47 
 
 		 459 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1295  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.73 
 
 		 568 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4540  Fis family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 607 aa  43.5  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 790 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 372 aa  42.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 1268 aa  42.7  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0447  putative sigma54 specific transcriptional regulator  21.9 
 
 		 438 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0918  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.55 
 
 		 297 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0046e-32 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 1171 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1333 aa  42.4  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.53 
 
 		 1040 aa  42.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1711  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 354 aa  42.4  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2152  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  20.8 
 
 		 300 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3592  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  23.48 
 
 		 519 aa  42.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 761 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 761 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.04 
 
 		 696 aa  42  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0252232  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>