42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0472 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0472  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  345  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.544597  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0438  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  345  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.684264 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0509  hypothetical protein  86.98 
 
 		 169 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.838827  normal  0.0478661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2699  PAS fold-4 domain protein  58.52 
 
 		 248 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4797  hypothetical protein  55.64 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0235215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0110  hypothetical protein  55.64 
 
 		 155 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0096  hypothetical protein  52.38 
 
 		 166 aa  163  9e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0492  hypothetical protein  53.33 
 
 		 166 aa  157  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0753  putative PAS/PAC sensor protein  53.28 
 
 		 237 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4708  putative PAS/PAC sensor protein  48.34 
 
 		 243 aa  152  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  56.9 
 
 		 602 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  49.56 
 
 		 725 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 		 907 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  39.81 
 
 		 744 aa  94.4  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 1261 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 491 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1559 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 1171 aa  55.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 1171 aa  51.2  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1711  putative PAS/PAC sensor protein  25.44 
 
 		 354 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1587  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.1 
 
 		 297 aa  47.8  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.275085  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 379 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2700  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.36 
 
 		 324 aa  44.7  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 840 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 746 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0589  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.57 
 
 		 305 aa  44.3  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1163  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.43 
 
 		 325 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.538197 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0229  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  31.33 
 
 		 1138 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0867  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.19 
 
 		 312 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.711393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 977 aa  42.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1337  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 126 aa  42.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0936  GGDEF domain-containing protein  27.5 
 
 		 301 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1371  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 516 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.768214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1130  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 748 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1103 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0034  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  29.41 
 
 		 806 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  31.67 
 
 		 1092 aa  41.2  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 487 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.22 
 
 		 1419 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.62 
 
 		 1042 aa  40.8  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 790 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 		 821 aa  40.8  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>