51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0509 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0509  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  346  7e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.838827  normal  0.0478661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0438  hypothetical protein  86.98 
 
 		 169 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.684264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0472  hypothetical protein  86.98 
 
 		 169 aa  311  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.544597  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2699  PAS fold-4 domain protein  62.22 
 
 		 248 aa  178  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0110  hypothetical protein  59.4 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0096  hypothetical protein  56.46 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4797  hypothetical protein  57.45 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0235215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0492  hypothetical protein  58.52 
 
 		 166 aa  168  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0753  putative PAS/PAC sensor protein  52.71 
 
 		 237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4708  putative PAS/PAC sensor protein  51.16 
 
 		 243 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  55.17 
 
 		 602 aa  141  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  48.67 
 
 		 725 aa  121  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 		 907 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  41.75 
 
 		 744 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1261 aa  67.8  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 1559 aa  62  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 1171 aa  58.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 1171 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1587  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.33 
 
 		 297 aa  50.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.275085  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0034  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  30.53 
 
 		 806 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0936  GGDEF domain-containing protein  29.17 
 
 		 301 aa  48.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1711  putative PAS/PAC sensor protein  24.55 
 
 		 354 aa  47.8  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  33.03 
 
 		 1092 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0867  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.77 
 
 		 312 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.711393  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.42 
 
 		 1419 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 1103 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  29.35 
 
 		 379 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 840 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 746 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1130  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 748 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 977 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 1042 aa  45.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.91 
 
 		 900 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0589  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.18 
 
 		 305 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1337  putative PAS/PAC sensor protein  31.63 
 
 		 126 aa  44.3  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 761 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1473  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1084 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 761 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 871 aa  43.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.363033  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1653  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.33 
 
 		 993 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 		 1297 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 		 673 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 1076 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 821 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 487 aa  41.6  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3196  Fis family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 494 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 		 1088 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.87 
 
 		 1359 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 520 aa  40.8  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 969 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356606  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>