39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0096 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0096  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  342  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0110  hypothetical protein  87.5 
 
 
155 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4797  hypothetical protein  86.84 
 
 
155 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0235215  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0492  hypothetical protein  80.72 
 
 
166 aa  278  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0509  hypothetical protein  56.46 
 
 
169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.838827  normal  0.0478661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0472  hypothetical protein  52.38 
 
 
169 aa  163  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.544597  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0438  hypothetical protein  52.38 
 
 
169 aa  163  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.684264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2699  PAS fold-4 domain protein  58.91 
 
 
248 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4708  putative PAS/PAC sensor protein  52.89 
 
 
243 aa  143  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320427  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0753  putative PAS/PAC sensor protein  49.61 
 
 
237 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  43.92 
 
 
602 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
725 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
907 aa  91.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  35.4 
 
 
744 aa  87  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.86 
 
 
1261 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
1559 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
491 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0936  GGDEF domain-containing protein  27.87 
 
 
301 aa  48.5  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1976  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  27.13 
 
 
461 aa  47.8  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.89 
 
 
1103 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  29.01 
 
 
1092 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
1171 aa  47.4  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
977 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1587  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.73 
 
 
297 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.275085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2302  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  24.65 
 
 
458 aa  45.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.957796  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
761 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
761 aa  44.7  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
840 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1580  transcriptional regulator  25.16 
 
 
464 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
746 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1684  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  24.6 
 
 
459 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0589  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.37 
 
 
305 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1130  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
748 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3196  Fis family transcriptional regulator  23.13 
 
 
494 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 
821 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2053  Fis family transcriptional regulator  30.28 
 
 
664 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1163  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.07 
 
 
325 aa  41.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.538197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1960  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.02 
 
 
318 aa  40.8  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
1171 aa  40.8  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135263 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>