35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0492 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0492  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  340  5.999999999999999e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.687324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0110  hypothetical protein  87.5 
 
 		 155 aa  280  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4797  hypothetical protein  86.18 
 
 		 155 aa  279  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0235215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0096  hypothetical protein  80.72 
 
 		 166 aa  278  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0509  hypothetical protein  58.52 
 
 		 169 aa  168  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.838827  normal  0.0478661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2699  PAS fold-4 domain protein  58.91 
 
 		 248 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0472  hypothetical protein  53.33 
 
 		 169 aa  157  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.544597  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0438  hypothetical protein  53.33 
 
 		 169 aa  157  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.684264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4708  putative PAS/PAC sensor protein  53.12 
 
 		 243 aa  148  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0753  putative PAS/PAC sensor protein  51.16 
 
 		 237 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  50.89 
 
 		 602 aa  127  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 		 725 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 907 aa  91.3  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  36.84 
 
 		 744 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 1261 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 1559 aa  57.8  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0899  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 491 aa  56.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1730  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1103 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.747769  normal  0.0625523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1455  PAS sensor protein  32.41 
 
 		 1092 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534076  normal  0.193101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 977 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.416631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1976  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  28.45 
 
 		 461 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.178847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0936  GGDEF domain-containing protein  26.45 
 
 		 301 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000986982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1587  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.73 
 
 		 297 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.275085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 1171 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.48946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1163  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.69 
 
 		 325 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  0.538197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1684  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  26.02 
 
 		 459 aa  44.3  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3196  Fis family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 494 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2302  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  27.73 
 
 		 458 aa  44.3  0.0009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.957796  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0589  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.15 
 
 		 305 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352095  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1580  transcriptional regulator  24.81 
 
 		 464 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 761 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.04 
 
 		 761 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 1191 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1190  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 746 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1259  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 840 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>