More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3037 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3037  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.585683 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000935  LysR-family transcriptional regulator  67.22 
 
 		 295 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0375861  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4777  LysR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 299 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1021  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 302 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3252  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  42.14 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000563268 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0969  LysR family substrate binding transcriptional regulator  42.14 
 
 		 302 aa  246  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3839  LysR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 302 aa  238  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3099  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 301 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3627  transcriptional regulator, LysR family  40.8 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3488  transcriptional regulator, LysR family  41.47 
 
 		 302 aa  230  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1543  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0458  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 309 aa  219  6e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.512377  normal  0.930115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2524  transcriptional regulator, LysR family  38.21 
 
 		 320 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2458  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115527  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1192  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0359  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475438  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1373  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.260945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2219  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.71 
 
 		 317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1266  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.50212  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0934  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0637  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1391  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2782  LysR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0196765  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4333  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 302 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.207282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4422  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1207  transcriptional regulator, LysR family  36.62 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0056  putative transcriptional regulator  40.13 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1323  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00680  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3307  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 314 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3163  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1031  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3164  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2349  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3473  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1387  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0754648  normal  0.547143 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1264  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  39.52 
 
 		 335 aa  208  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1091  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1157  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1091  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.93926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2447  transcriptional regulator, LysR family  39.6 
 
 		 294 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.707294  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 304 aa  205  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1807  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 305 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.625247  normal  0.540771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  37.2 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1852  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.387981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2042  LysR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 297 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.579809 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8728  transcriptional regulator, LysR family  38.28 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.31 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3222  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 302 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0186  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 307 aa  183  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3512  transcriptional regulator  35.99 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0611  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2820  transcriptional regulator  33 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309503  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  35.27 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3303  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3342  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3094  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473286  normal  0.0793599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33170  putative transcriptional regulator  33.67 
 
 		 304 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.162388  hitchhiker  0.0024503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  36.16 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  33.55 
 
 		 335 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5286  transcriptional regulator, LysR family  35.84 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0180264  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0137  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 302 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  34.31 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  32.67 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0776  transcriptional regulator, LysR family protein  34.95 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  34.24 
 
 		 302 aa  176  6e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3812  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0606  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3630  transcriptional regulator, LysR family  34.26 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3688  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1066  LysR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 298 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05458  transcription regulator protein  33.79 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3808  transcriptional regulator LysR family  33.78 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1128  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 328 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1271  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 324 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658069  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1560  LysR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.987371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2792  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.11 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2868  transcriptional regulator, LysR family protein  30.51 
 
 		 313 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0376307  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1324  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.230209 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 303 aa  169  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1305  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 307 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.186242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  33.01 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>