35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0384 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  100 
 
 		 176 aa  356  9.999999999999999e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  98.86 
 
 		 176 aa  350  4e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  97.73 
 
 		 176 aa  349  1e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  89.2 
 
 		 177 aa  327  7e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  70.52 
 
 		 174 aa  259  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0349  tRNA splicing endonuclease  35.16 
 
 		 350 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0895674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0450  tRNA intron endonuclease  32.93 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000001619 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0700  tRNA splicing endonuclease  34.81 
 
 		 351 aa  90.1  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.201775  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1416  tRNA intron endonuclease  37.59 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2217  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  35.88 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000332759 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1040  tRNA splicing endonuclease  29.94 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000280827  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0619  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  36.03 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1039  tRNA intron endonuclease  31.62 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0311  tRNA intron endonuclease domain-containing protein  31.48 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0572  tRNA intron endonuclease  48.31 
 
 		 289 aa  74.7  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000000000753451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1733  tRNA splicing endonuclease  30.41 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0655  tRNA splicing endonuclease  30.64 
 
 		 352 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.524878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0641  tRNA splicing endonuclease  31.9 
 
 		 336 aa  67.4  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3615  tRNA intron endonuclease  28.49 
 
 		 351 aa  64.7  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1669  tRNA splicing endonuclease  31.78 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.468654  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1368  tRNA splicing endonuclease  27.33 
 
 		 336 aa  61.6  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.190431  hitchhiker  0.000000711532 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0572  tRNA splicing endonuclease  29.22 
 
 		 348 aa  60.8  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199191  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1687  tRNA intron endonuclease  29.94 
 
 		 375 aa  58.2  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0666  tRNA intron endonuclease  28.82 
 
 		 336 aa  58.2  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.303013 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1435  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  29.71 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0893  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.43 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.935192 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1630  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  29.75 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0348  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.67 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1819  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  26.81 
 
 		 183 aa  52  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.66426 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2070  tRNA splicing endonuclease  33.33 
 
 		 400 aa  47.8  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0810012 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_92995  predicted protein  31.52 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38031  predicted protein  29.13 
 
 		 383 aa  45.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1079  hypothetical protein  28.72 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.602649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2266  tRNA-splicing endonuclease subunit beta  28.87 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1747  tRNA intron endonuclease, catalytic-like protein  27.06 
 
 		 184 aa  42  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.817286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>