32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2217 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2217  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  100 
 
 		 182 aa  366  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000332759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1416  tRNA intron endonuclease  54.24 
 
 		 182 aa  205  4e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0348  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  40 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0619  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  39.41 
 
 		 171 aa  132  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1039  tRNA intron endonuclease  36.76 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1819  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  37.16 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.66426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0893  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  37.5 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.935192 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1435  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  35.52 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1630  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  34.97 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  33.33 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0349  tRNA splicing endonuclease  29.03 
 
 		 350 aa  84.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0895674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1040  tRNA splicing endonuclease  28.66 
 
 		 351 aa  82  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000280827  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  35.88 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  35.88 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1669  tRNA splicing endonuclease  31.33 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.468654  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  36.64 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  34.35 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0700  tRNA splicing endonuclease  31.45 
 
 		 351 aa  78.2  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.201775  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2070  tRNA splicing endonuclease  30.39 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0810012 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0666  tRNA intron endonuclease  27.06 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.303013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3615  tRNA intron endonuclease  28.32 
 
 		 351 aa  65.1  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0572  tRNA splicing endonuclease  27.22 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199191  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1687  tRNA intron endonuclease  28.16 
 
 		 375 aa  62.4  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0655  tRNA splicing endonuclease  28.99 
 
 		 352 aa  60.8  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.524878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0572  tRNA intron endonuclease  33.33 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000000000753451  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0641  tRNA splicing endonuclease  26.28 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1733  tRNA splicing endonuclease  29.63 
 
 		 335 aa  54.7  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38031  predicted protein  36.05 
 
 		 383 aa  54.3  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1368  tRNA splicing endonuclease  30 
 
 		 336 aa  53.9  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.190431  hitchhiker  0.000000711532 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08255  DNA damage repair protein (Rad9), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04020)  48.89 
 
 		 1851 aa  50.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.802906 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_92995  predicted protein  31.87 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0450  tRNA intron endonuclease  28.38 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000001619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>