36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1039 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1039  tRNA intron endonuclease  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0893  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  42.86 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.935192 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1819  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  41.21 
 
 		 183 aa  138  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.66426 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2217  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  36.76 
 
 		 182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000332759 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1435  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  39.56 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1630  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  39.56 
 
 		 184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0348  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  37.08 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1416  tRNA intron endonuclease  36.11 
 
 		 182 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0619  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  33.93 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0349  tRNA splicing endonuclease  31.07 
 
 		 350 aa  87.8  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0895674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1040  tRNA splicing endonuclease  33.33 
 
 		 351 aa  85.5  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000280827  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  32.35 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.62 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0700  tRNA splicing endonuclease  28.42 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.201775  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.88 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  32.86 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  27.33 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3615  tRNA intron endonuclease  27.22 
 
 		 351 aa  68.2  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0666  tRNA intron endonuclease  26.7 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.303013 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0450  tRNA intron endonuclease  28.57 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000001619 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1669  tRNA splicing endonuclease  26.83 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.468654  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0641  tRNA splicing endonuclease  30.17 
 
 		 336 aa  62  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1687  tRNA intron endonuclease  28.57 
 
 		 375 aa  62  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1733  tRNA splicing endonuclease  32.77 
 
 		 335 aa  61.6  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2070  tRNA splicing endonuclease  24.72 
 
 		 400 aa  61.2  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0810012 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0655  tRNA splicing endonuclease  23.21 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.524878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1368  tRNA splicing endonuclease  25.15 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.190431  hitchhiker  0.000000711532 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0572  tRNA splicing endonuclease  30.25 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199191  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38031  predicted protein  27.05 
 
 		 383 aa  53.9  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00190  tRNA-splicing endonuclease subunit sen34 (AFU_orthologue; AFUA_5G11140)  32.88 
 
 		 310 aa  53.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.11347  normal  0.340006 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_92995  predicted protein  27.85 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08255  DNA damage repair protein (Rad9), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04020)  42.86 
 
 		 1851 aa  48.5  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.802906 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31261  predicted protein  32.89 
 
 		 295 aa  47  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00981052  normal  0.533075 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0572  tRNA intron endonuclease  35.21 
 
 		 289 aa  45.4  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000000000753451  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05820  tRNA-intron endonuclease, putative  41.3 
 
 		 533 aa  42  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01760  hypothetical protein  30.93 
 
 		 325 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>