31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0655 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0655  tRNA splicing endonuclease  100 
 
 		 352 aa  716    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.524878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0641  tRNA splicing endonuclease  56.89 
 
 		 336 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0572  tRNA splicing endonuclease  58.33 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199191  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1733  tRNA splicing endonuclease  54.46 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1368  tRNA splicing endonuclease  47.67 
 
 		 336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.190431  hitchhiker  0.000000711532 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1040  tRNA splicing endonuclease  36.75 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000280827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0349  tRNA splicing endonuclease  37.14 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0895674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0700  tRNA splicing endonuclease  35.65 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.201775  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3615  tRNA intron endonuclease  33.24 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0666  tRNA intron endonuclease  31.9 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.303013 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1687  tRNA intron endonuclease  33.62 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1669  tRNA splicing endonuclease  30.39 
 
 		 348 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.468654  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2070  tRNA splicing endonuclease  28.1 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0810012 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0572  tRNA intron endonuclease  28.8 
 
 		 289 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000000000753451  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.23 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.79 
 
 		 177 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.64 
 
 		 176 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.43 
 
 		 176 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  29.48 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0450  tRNA intron endonuclease  34.97 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000001619 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2217  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  28.99 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000332759 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1039  tRNA intron endonuclease  23.21 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0348  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  28.57 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0619  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  33.97 
 
 		 171 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1416  tRNA intron endonuclease  27.74 
 
 		 182 aa  50.8  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0311  tRNA intron endonuclease domain-containing protein  31.1 
 
 		 193 aa  50.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1819  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.25 
 
 		 183 aa  46.2  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.66426 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1747  tRNA intron endonuclease, catalytic-like protein  33.33 
 
 		 184 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.817286  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1256  tRNA intron endonuclease, catalytic domain protein  23.9 
 
 		 140 aa  44.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0893  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  27.94 
 
 		 183 aa  43.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.935192 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2266  tRNA-splicing endonuclease subunit beta  30.69 
 
 		 124 aa  42.7  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.87026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>