18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1747 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1747  tRNA intron endonuclease, catalytic-like protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.817286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1040  tRNA splicing endonuclease  26.67 
 
 		 351 aa  51.6  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000280827  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0700  tRNA splicing endonuclease  26.21 
 
 		 351 aa  51.2  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.201775  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0666  tRNA intron endonuclease  27.54 
 
 		 336 aa  51.2  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.303013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1669  tRNA splicing endonuclease  25.76 
 
 		 348 aa  48.5  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.468654  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1687  tRNA intron endonuclease  25 
 
 		 375 aa  47.8  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0572  tRNA splicing endonuclease  30.88 
 
 		 348 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199191  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0311  tRNA intron endonuclease domain-containing protein  29.6 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3615  tRNA intron endonuclease  24.22 
 
 		 351 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0655  tRNA splicing endonuclease  33.33 
 
 		 352 aa  45.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.524878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1733  tRNA splicing endonuclease  29.6 
 
 		 335 aa  44.7  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.23 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  27.06 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0349  tRNA splicing endonuclease  23.66 
 
 		 350 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0895674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  27.06 
 
 		 176 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  27.06 
 
 		 176 aa  42  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  27.06 
 
 		 176 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1368  tRNA splicing endonuclease  28.97 
 
 		 336 aa  41.6  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.190431  hitchhiker  0.000000711532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>