35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0454 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  100 
 
 		 177 aa  355  9.999999999999999e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  89.2 
 
 		 176 aa  327  7e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  88.64 
 
 		 176 aa  326  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  88.64 
 
 		 176 aa  323  6e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  66.47 
 
 		 174 aa  251  4.0000000000000004e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0349  tRNA splicing endonuclease  34.07 
 
 		 350 aa  100  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0895674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0450  tRNA intron endonuclease  30.49 
 
 		 199 aa  92  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000001619 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0700  tRNA splicing endonuclease  34.81 
 
 		 351 aa  86.7  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.201775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1040  tRNA splicing endonuclease  31.06 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000280827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1416  tRNA intron endonuclease  38.35 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2217  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  36.64 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000332759 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0572  tRNA intron endonuclease  49.44 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000000000753451  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0311  tRNA intron endonuclease domain-containing protein  32.1 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0619  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  36.03 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1733  tRNA splicing endonuclease  31.76 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1039  tRNA intron endonuclease  32.86 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0655  tRNA splicing endonuclease  31.79 
 
 		 352 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.524878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0572  tRNA splicing endonuclease  31.79 
 
 		 348 aa  67.8  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199191  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1368  tRNA splicing endonuclease  29.81 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.190431  hitchhiker  0.000000711532 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0641  tRNA splicing endonuclease  29.01 
 
 		 336 aa  65.1  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3615  tRNA intron endonuclease  28.9 
 
 		 351 aa  61.6  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1669  tRNA splicing endonuclease  33.33 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.468654  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1687  tRNA intron endonuclease  32.34 
 
 		 375 aa  58.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1630  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  32.23 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0666  tRNA intron endonuclease  30 
 
 		 336 aa  57.8  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.303013 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0893  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  32.61 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.935192 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1435  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.43 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0348  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  34.17 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1819  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  28.99 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.66426 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_92995  predicted protein  33.7 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38031  predicted protein  29.13 
 
 		 383 aa  48.1  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2070  tRNA splicing endonuclease  28.57 
 
 		 400 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0810012 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1079  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.602649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2266  tRNA-splicing endonuclease subunit beta  30.93 
 
 		 124 aa  44.7  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1747  tRNA intron endonuclease, catalytic-like protein  27.06 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.817286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>