30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0572 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0572  tRNA intron endonuclease  100 
 
 		 289 aa  590  1e-168  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000000000753451  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1040  tRNA splicing endonuclease  29.36 
 
 		 351 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000280827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0349  tRNA splicing endonuclease  30.91 
 
 		 350 aa  106  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0895674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0700  tRNA splicing endonuclease  31.02 
 
 		 351 aa  106  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.201775  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0641  tRNA splicing endonuclease  28.79 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1368  tRNA splicing endonuclease  29.91 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.190431  hitchhiker  0.000000711532 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0655  tRNA splicing endonuclease  28.8 
 
 		 352 aa  91.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.524878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1687  tRNA intron endonuclease  30.19 
 
 		 375 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1733  tRNA splicing endonuclease  28.8 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3615  tRNA intron endonuclease  27.96 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0572  tRNA splicing endonuclease  27.62 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199191  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1669  tRNA splicing endonuclease  27.24 
 
 		 348 aa  79.3  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.468654  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  49.44 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  48.31 
 
 		 176 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  48.31 
 
 		 176 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  48.31 
 
 		 176 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0666  tRNA intron endonuclease  28.26 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.303013 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0619  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  42.7 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  43.82 
 
 		 174 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2070  tRNA splicing endonuclease  26.15 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0810012 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0348  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  37.12 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2217  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  33.33 
 
 		 182 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000332759 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0311  tRNA intron endonuclease domain-containing protein  28.81 
 
 		 193 aa  55.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1630  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  33.83 
 
 		 184 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0893  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  33.83 
 
 		 183 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.935192 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1435  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  37.78 
 
 		 183 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1819  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  36.67 
 
 		 183 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.66426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1416  tRNA intron endonuclease  36.94 
 
 		 182 aa  53.5  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0450  tRNA intron endonuclease  29.76 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000001619 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1039  tRNA intron endonuclease  35.21 
 
 		 178 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>