33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1630 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1630  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  100 
 
 		 184 aa  363  1e-100  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1435  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  83.61 
 
 		 183 aa  310  5.999999999999999e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1819  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  83.61 
 
 		 183 aa  308  2e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.66426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0893  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  82.51 
 
 		 183 aa  309  2e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.935192 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0348  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  52.51 
 
 		 192 aa  184  4e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1416  tRNA intron endonuclease  37.5 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1039  tRNA intron endonuclease  39.56 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0619  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  43.02 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2217  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  34.97 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000332759 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0700  tRNA splicing endonuclease  31.06 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.201775  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0349  tRNA splicing endonuclease  31.65 
 
 		 350 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0895674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1669  tRNA splicing endonuclease  34.87 
 
 		 348 aa  67  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.468654  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0572  tRNA splicing endonuclease  32.79 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199191  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1733  tRNA splicing endonuclease  30.18 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1040  tRNA splicing endonuclease  28.75 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000280827  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  32.23 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3615  tRNA intron endonuclease  31.85 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.58 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0666  tRNA intron endonuclease  33.55 
 
 		 336 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.303013 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  25.71 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0572  tRNA intron endonuclease  33.83 
 
 		 289 aa  55.5  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000000000753451  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  29.75 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1687  tRNA intron endonuclease  31.65 
 
 		 375 aa  55.1  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2070  tRNA splicing endonuclease  30.98 
 
 		 400 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0810012 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  28.93 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38031  predicted protein  33.33 
 
 		 383 aa  51.6  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0641  tRNA splicing endonuclease  25.21 
 
 		 336 aa  51.6  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1368  tRNA splicing endonuclease  28.57 
 
 		 336 aa  50.1  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.190431  hitchhiker  0.000000711532 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08255  DNA damage repair protein (Rad9), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04020)  46.51 
 
 		 1851 aa  48.9  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.802906 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00190  tRNA-splicing endonuclease subunit sen34 (AFU_orthologue; AFUA_5G11140)  29.9 
 
 		 310 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.11347  normal  0.340006 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05820  tRNA-intron endonuclease, putative  39.53 
 
 		 533 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0655  tRNA splicing endonuclease  28.69 
 
 		 352 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.524878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31261  predicted protein  32.86 
 
 		 295 aa  42.4  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00981052  normal  0.533075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>