18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_38031 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_38031  predicted protein  100 
 
 		 383 aa  788    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08255  DNA damage repair protein (Rad9), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04020)  31.83 
 
 		 1851 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.802906 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05820  tRNA-intron endonuclease, putative  30.24 
 
 		 533 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1416  tRNA intron endonuclease  33.33 
 
 		 182 aa  61.6  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26883  predicted protein  26.23 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.444518 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1039  tRNA intron endonuclease  27.05 
 
 		 178 aa  53.9  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2217  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  36.05 
 
 		 182 aa  54.3  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000332759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0893  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  34.57 
 
 		 183 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.935192 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1630  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  33.33 
 
 		 184 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1819  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  33.33 
 
 		 183 aa  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.66426 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0348  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.71 
 
 		 192 aa  50.1  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0619  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  34.21 
 
 		 171 aa  49.7  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  29.46 
 
 		 174 aa  49.7  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1435  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  33.33 
 
 		 183 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  29.13 
 
 		 177 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  29.13 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  29.13 
 
 		 176 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.33 
 
 		 176 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>