29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0666 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0666  tRNA intron endonuclease  100 
 
 		 336 aa  668    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.303013 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1669  tRNA splicing endonuclease  61.89 
 
 		 348 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.468654  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3615  tRNA intron endonuclease  59.36 
 
 		 351 aa  365  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1687  tRNA intron endonuclease  51.91 
 
 		 375 aa  342  5.999999999999999e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2070  tRNA splicing endonuclease  47.55 
 
 		 400 aa  295  8e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0810012 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1040  tRNA splicing endonuclease  37.91 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000280827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0349  tRNA splicing endonuclease  37.95 
 
 		 350 aa  192  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0895674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0700  tRNA splicing endonuclease  38.55 
 
 		 351 aa  189  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.201775  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1733  tRNA splicing endonuclease  33.93 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0572  tRNA splicing endonuclease  33.13 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199191  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0641  tRNA splicing endonuclease  31.83 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0655  tRNA splicing endonuclease  31.9 
 
 		 352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.524878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1368  tRNA splicing endonuclease  29.85 
 
 		 336 aa  113  5e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.190431  hitchhiker  0.000000711532 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0572  tRNA intron endonuclease  28.26 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000000000753451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2217  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  27.06 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000332759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1416  tRNA intron endonuclease  28.75 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1039  tRNA intron endonuclease  26.7 
 
 		 178 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  29.41 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0348  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  29.38 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  29.55 
 
 		 174 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  28.82 
 
 		 176 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  28.82 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1630  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  33.55 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1819  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.87 
 
 		 183 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.66426 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0893  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.3 
 
 		 183 aa  52.8  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.935192 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1747  tRNA intron endonuclease, catalytic-like protein  27.54 
 
 		 184 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.817286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1435  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  32 
 
 		 183 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0619  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  27.08 
 
 		 171 aa  45.8  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>