30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1687 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1687  tRNA intron endonuclease  100 
 
 		 375 aa  743    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3615  tRNA intron endonuclease  75.47 
 
 		 351 aa  542  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1669  tRNA splicing endonuclease  55.62 
 
 		 348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.468654  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0666  tRNA intron endonuclease  51.91 
 
 		 336 aa  342  7e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.303013 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2070  tRNA splicing endonuclease  50.25 
 
 		 400 aa  324  2e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0810012 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0700  tRNA splicing endonuclease  39.44 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.201775  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1040  tRNA splicing endonuclease  34.99 
 
 		 351 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000280827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0349  tRNA splicing endonuclease  36.24 
 
 		 350 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0895674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0641  tRNA splicing endonuclease  32.58 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1733  tRNA splicing endonuclease  32.3 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0572  tRNA splicing endonuclease  30.09 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.199191  normal  0.204631 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0655  tRNA splicing endonuclease  33.62 
 
 		 352 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.524878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1368  tRNA splicing endonuclease  28.99 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.190431  hitchhiker  0.000000711532 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0572  tRNA intron endonuclease  30.19 
 
 		 289 aa  90.1  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000000000753451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2217  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  28.16 
 
 		 182 aa  62.4  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000332759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1416  tRNA intron endonuclease  29.05 
 
 		 182 aa  62.8  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1039  tRNA intron endonuclease  28.57 
 
 		 178 aa  62  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1014  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.62 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.703035  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1819  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.85 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.66426 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0452  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.54 
 
 		 176 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0454  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  32.34 
 
 		 177 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0384  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  29.94 
 
 		 176 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.295816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0893  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.65 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.935192 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1535  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  30.12 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1630  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.65 
 
 		 184 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1435  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.87 
 
 		 183 aa  54.7  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0619  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  32.84 
 
 		 171 aa  53.5  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0348  tRNA-splicing endonuclease subunit alpha  31.4 
 
 		 192 aa  50.8  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0311  tRNA intron endonuclease domain-containing protein  34.81 
 
 		 193 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1747  tRNA intron endonuclease, catalytic-like protein  25 
 
 		 184 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.817286  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>